在一个大应用程序中捆绑多个独立但相关的python工具

Question

我一直在寻找实现这一目标的方法，但找不到一个。

我有多个python脚本，其中一些是预处理实用工具，一些执行数据分析，有些创建可视化。它们都是相关的，但可能相互依赖，也可能不相互依赖，并且可能具有单独的输入参数。我正在尝试在一个软件包中创建一套工具，并希望用户根据需要选择并运行该工具/模块。

例如：这是一个名为GATK的基于Java的软件。 “ gatk”是一个.jar，其中包含多个工具，其中一个是“ AnnotateIntervals”，并且具有一组输入要求。用户以这种方式运行

gatk AnnotateIntervals \
          -R reference.fa \
          -L intervals.interval_list \
          --interval-merging-rule OVERLAPPING_ONLY \
          -O annotated_intervals.tsv

https://gatk.broadinstitute.org/hc/en-us/articles/360040098252-AnnotateIntervals

我想在python中开发完全像这样的东西，

main_app.py first_module -l <> -m <>这可能吗？如果可以，我该如何实现？

Answer 1

您可能想读setuptools' entry-points和/或argparse's sub-commands。这只是一种组合，可能是大多数“ standard”组合，但是还有许多其他选择。