我一直在使用 Cytoscape 3.9.1 版和 ClueGO 2.5.10 版，一切都很顺利，直到我尝试更新 Gene Ontology 源代码。不幸的是，更新过程失败了3次。随后，当我运行 ClueGO 进行富集分析时，Cytoscape 在最后一步崩溃并突然关闭。
为了解决该问题，我将 Cytoscape 升级到版本 3.10.1，其中还包括对 Java 的升级。然而，即使更新了，同样的问题仍然存在，ClueGO 在最后一步再次崩溃。 我正在寻求有关如何解决这个反复出现的问题的指导。任何帮助或建议将不胜感激。
我想提供我所面临的问题的最新信息，并且我设法自己解决了它。事实证明我也需要更新 CluePedia。进行此更新后，我发现 Cytoscape 版本 3.10.1、Java 版本 17、ClueGO 版本 2.5.10 和 CluePedia 版本 1.5.10 可以无缝协作，没有任何问题。 我希望这些信息可以对可能遇到类似问题的其他人有所帮助。