Cytoscape 无法启动

Question

我想知道是否有人可以帮助我解决 Cytoscape 启动问题。以前可以正常启动，但现在无法启动了。我多次重新安装 Cytoscape。当我运行检查器脚本（在故障排除页面上描述）时，出现“我收到 Java 无法访问”的消息。请参阅附件我重新安装了Java 11但仍然没有运气。这是我的 CytoscapeConfiguration 文件夹，看起来像 。提前谢谢大家。

仅供参考

• MacOS 莫哈韦沙漠。
• Cytoscape 3.9.0

在“JavaVirtualMachines”目录中，有：

• 采用openjdk-11.jdk
• jdk-11.0.12.jdk
• jdk-12.0.1.jdk

Answer 1

您安装了多个 Java JDK，但不清楚其中哪个是活动的。确定这一点的最简单方法是打开终端窗口并输入

which java

。

这应该给你一个指向实际 Java 二进制文件的指针（在我的 Mac 上它是 /Library/Java/JavaVirtualMachines/adoptopenjdk-11.jdk/Contents/Home/bin/java ）。如果没有返回任何内容，则表明 Java 没有正确安装。您可以尝试将

JAVA_HOME

显式设置为正确的 JDK (/Library/Java/JavaVirtualMachines/adoptopenjdk-11.jdk/Contents/Home) 并查看是否有效。