问题在DESeq数据帧中从行名中删除最后两个字符

Question

谢谢您的帮助

我有一个数据帧，它来自与DESeq2库的一些解析和比较，但最后是一个看起来像这样的大数据帧：

> resEvN
log2 fold change (MLE): Group ELI vs NIT 
Wald test p-value: Group ELI vs NIT 
DataFrame with 56202 rows and 6 columns
                           baseMean       log2FoldChange ...[6]
                          <numeric>            <numeric>
ENSG00000223972.4  2.78292492689073    -0.24207616846296
ENSG00000227232.4  735.590503798565   0.0496174362951506
ENSG00000243485.2  1.46155527975626  -0.0765072904209051
ENSG00000237613.2  1.48824886356107 -0.00915380882252464
ENSG00000268020.2 0.746673256410335  -0.0111420404366476

总共有6列和56202行。

Mi问题是，我需要在不干扰data.frame的情况下从row.name的末尾删除“ .X”。

因此将ENSG00000268020.2转换为ENSG00000268020

我尝试了几件事，但似乎没有任何效果，例如：

row.names(sub_resEvN)= substr(row.names(sub_resEvN), nchar(row.names(sub_resEvN)), -2)

or

substr(rownames(sub_resEvN), nchar(rownames(sub_resEvN))-2, nchar(rownames(sub_resEvN)))

任何想法？

谢谢

Answer 1

您不允许具有相同名称的多个行名称。如果重复，则必须使用修改后的名称创建一个新列。是否仍然需要此信息。

rownames(sub_resEvN) <- sub("\\.\\d$","",rownames(sub_resEvN))

或
sub_resEvN$New_Column <- sub("\\.\\d$","",rownames(sub_resEvN))