.External.graphics 中的错误和图形边距太大

Question

我使用下面的函数从 48 列 X 32 行的矩阵创建热图：

heatmap.2(all.data,Rowv = FALSE, Colv = FALSE, trace="none",main="All data",col=colorRampPalette(c("green","yellow","red")))

由于删除了树状图，它给了我一些警告，但它仍然给了我我想要的热图加上颜色键，发生了一些事情，现在当我尝试运行相同的东西时，它给了我没有颜色键的图，错误：

Error in plot.new() : figure margins too large
In addition: Warning messages:
1: In heatmap.2(all.data, Rowv = FALSE, Colv = FALSE, trace = "none",  :
  Discrepancy: Rowv is FALSE, while dendrogram is `both'. Omitting row dendogram.
2: In heatmap.2(all.data, Rowv = FALSE, Colv = FALSE, trace = "none",  :
  Discrepancy: Colv is FALSE, while dendrogram is `none'. Omitting column dendogram.

如果我将所有边的边距更改为 1：

par(mar=c(1,1,1,1))
heatmap.2(all.data,Rowv = FALSE, Colv = FALSE, trace="none",main="All data",col=colorRampPalette(c("green","yellow","red")))

然后再试一次，它不会制作热图并给我这个错误：

Error in .External.graphics(C_layout, num.rows, num.cols, mat, as.integer(num.figures),  : 
  invalid graphics state
In addition: Warning messages:
1: In heatmap.2(all.data, Rowv = FALSE, Colv = FALSE, trace = "none",  :
  Discrepancy: Rowv is FALSE, while dendrogram is `both'. Omitting row dendogram.
2: In heatmap.2(all.data, Rowv = FALSE, Colv = FALSE, trace = "none",  :
  Discrepancy: Colv is FALSE, while dendrogram is `none'. Omitting column dendogram.

我还尝试添加功能键=T，但颜色键仍然没有出现在热图中。怎么解决这个问题？

Answer 1

如果您的绘图过去一直有效，但现在抛出

invalid graphics state

错误，请尝试通过调用

dev.off()

重置图形设备。这是 RStudio 帮助网站建议的。

Answer 2

想通了；这只是显示器的错误。如果我自动保存绘图而不是要求 RStudio 将其显示给我，则图表就可以了

Answer 3

我在RStudio中也发现了这个问题。 可以通过增加 RStudio 中绘图窗口的垂直尺寸来解决（否则部分绘图不适合窗口并发生错误）。

Answer 4

我通过在堆叠窗口之前最大化窗口来做到这一点。

Answer 5

这是与RStudio相关的问题。如果增加显示面板应该可以正常工作。这是假设没有其他编码错误的情况。