与 RStudio 绘图相比，ggplot 图表在 knitted 文档中呈现不同的方式

Question

考虑以下两张图片。两者使用相同的代码，但呈现方式不同。第一个是出现在 RStudio 的“绘图”面板中的图像，第二个是出现在相应的 knitted HTML 文档中的图像。

观察“低于 0.1”标签的“图例”中的差异。为什么knitr 以不同的方式呈现文档，并用图例标签中绘图的灰色背景色替换黑色？ （我意识到没有低于 0.1 的值，因此它们“丢失”，但我特别希望即使这些值丢失，图例标签仍然出现。）

我的代码位于：

https://github.com/a-s-russo/austemp

特别是，请参阅 weather_graphs.html 分支中的

pipeline

文件，该文件生成上面的knitr 图像。上面的 RStudio 图像可以通过按照

main

分支页面上的说明安装软件包来重现（或参见下面的前三行代码）。这两个图像都是使用以下调用

plot_temperatures()

创建的：

> devtools::install_github("a-s-russo/austemp")
> library(austemp)
> data('Sydney')
> plot_temperatures(data = Sydney, season = 'winter')

（注意：忽略图像大小差异。这只是因为我为了创建这个问题而调整大小并保存它们的方式。）

Answer 1

sessionInfo()

添加到两个输出（RStudio 和 RMarkdown），因为我无法在我的系统 (macOS) 上重现该问题：

# devtools::install_github("a-s-russo/austemp")
library(austemp)
data('Sydney')
plot_temperatures(data = Sydney, season = 'winter')
#> The ending year has been adjusted to match the data availability

sessionInfo()
#> R version 4.3.0 (2023-04-21)
#> Platform: x86_64-apple-darwin20 (64-bit)
#> Running under: macOS Ventura 13.6.5
#> 
#> Matrix products: default
#> BLAS:   /Library/Frameworks/R.framework/Versions/4.3-x86_64/Resources/lib/libRblas.0.dylib 
#> LAPACK: /Library/Frameworks/R.framework/Versions/4.3-x86_64/Resources/lib/libRlapack.dylib;  LAPACK version 3.11.0
#> 
#> locale:
#> [1] en_US.UTF-8/en_US.UTF-8/en_US.UTF-8/C/en_US.UTF-8/en_US.UTF-8
#> 
#> time zone: Australia/Melbourne
#> tzcode source: internal
#> 
#> attached base packages:
#> [1] stats     graphics  grDevices utils     datasets  methods   base     
#> 
#> other attached packages:
#> [1] austemp_0.1
#> 
#> loaded via a namespace (and not attached):
#>  [1] styler_1.10.2     utf8_1.2.4        generics_0.1.3    tidyr_1.3.1      
#>  [5] xml2_1.3.6        lattice_0.22-5    stringi_1.8.3     hms_1.1.3        
#>  [9] digest_0.6.34     magrittr_2.0.3    evaluate_0.23     grid_4.3.0       
#> [13] timechange_0.3.0  padr_0.6.2        fastmap_1.1.1     R.oo_1.25.0      
#> [17] R.cache_0.16.0    R.utils_2.12.3    httr_1.4.7        rvest_1.0.4      
#> [21] purrr_1.0.2       fansi_1.0.6       scales_1.3.0      cli_3.6.2        
#> [25] rlang_1.1.3       R.methodsS3_1.8.2 munsell_0.5.0     reprex_2.1.0     
#> [29] withr_3.0.0       yaml_2.3.8        tools_4.3.0       tzdb_0.4.0       
#> [33] dplyr_1.1.4       colorspace_2.1-0  ggplot2_3.5.0     vctrs_0.6.5      
#> [37] R6_2.5.1          zoo_1.8-12        lifecycle_1.0.4   lubridate_1.9.3  
#> [41] stringr_1.5.1     fs_1.6.3          pkgconfig_2.0.3   pillar_1.9.0     
#> [45] gtable_0.3.4      glue_1.7.0        Rcpp_1.0.12       xfun_0.41        
#> [49] tibble_3.2.1      tidyselect_1.2.1  rstudioapi_0.15.0 knitr_1.45       
#> [53] farver_2.1.1      htmltools_0.5.7   rmarkdown_2.25    readr_2.1.5      
#> [57] compiler_4.3.0

创建于 2024-03-25，使用

reprex v2.1.0

通过 Rstudio 导出时（png 和 pdf 的结果相同）：

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RMarkdown 输出截图：

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