我正在做一个蛋白质-蛋白质相互作用网络。
在某些情况下,源蛋白和目标蛋白具有相同的名称(尽管它们实际上并不相同,但它们具有相同的名称)
将其加载到 Cytoscape 时,仅显示一个具有该名称的节点。从技术上讲,我需要两个以该名称显示的节点,因为它们是单独的蛋白质。
Cytoscape 桌面并不真正关心名称的唯一性,但是当您导入文件时,必须有一些唯一的列可用于区分两个不同的节点。它可以是带有 uniprot 标识符、entrez、ensembl 的列,甚至是您编写的自定义节点号。加载网络后,您可以指向包含您的姓名的列以进行可视化。