我已经为R中的一个物种计算了内核密度估计(KDE),为简化起见,我在这里使用spatstat的ants数据集(蚂蚁巢),我会希望有一个带有每个测量单位(例如m²)的蚁巢数量的图例标度。如果我正确理解KDE图例显示的概率密度在0到1之间,该如何以“实际”密度(例如,每m²的点(蚁巢))转换该概率?
这里是示例:
require("spatstat")
data(ants)
dat <- ants
# estimate bandwith
h_cox <- bw.diggle(dat)
# calculate KDE
kd_cox <- density(dat, h_cox, diggle=TRUE, se=TRUE, eps=diff(dat$window$xrange)/500)
# Plot KDE, contours and points
plot(kd_cox$estimate, main="KDE ants bw.diggle")
contour(kd_cox$estimate, labels="", add=TRUE, col=gray(.5))
points(dat)
感谢您对示例数据有一个明确的问题。