带有 p 值过滤器以确定重要性的简单脚本？

Question

我需要创建一个带有 p 值过滤器的简单脚本来衡量 40 个特征的重要性，每个特征有 3 个不同的站点（总共 120 组不同的 p 值）。因此，我需要通过站点/特征循环脚本以进行分析。以下是这些数据格式的预览：

我该怎么做？我不知道从哪里开始。

运行此脚本后我会问自己的问题：

1. 有多少个重要的SNP？
2. 对于给定性状，所有位点中有多少 SNP 是显着的？

等