将for循环中的多个图像插入Sweave文档中

Question

我有五个存储的图像，如下所示（其中“ currentDirectory”是我从命令getwd（）获得的结果：]

currentDirectory/results/thePlot_1.jpg
currentDirectory/results/thePlot_2.jpg
currentDirectory/results/thePlot_3.jpg
currentDirectory/results/thePlot_4.jpg
currentDirectory/results/thePlot_5.jpg

[我正在尝试在Rstudio中编写一个.Rnw脚本，该脚本将创建.tex文件，然后我可以对其运行pdflatex，以使.pdf文件包含这五个图像。以下是我尝试过的内容：

\documentclass{article}
\usepackage{float, hyperref}
\usepackage[margin=1in]{geometry}
\usepackage{graphicx}
\usepackage{hyperref}
\usepackage{caption}
\usepackage{algorithm}
\usepackage{algorithmic}

\begin{document}
\SweaveOpts{concordance=TRUE}

\author{myName}
\title{myTitle}

\maketitle

<<options, echo=FALSE>>=
library(knitr)
  opts_chunk$set(cache=TRUE)
@

\section*{mySection}

\FOR{i in 1:5}
nPlots=i
plotName = "thePlot"
outDir = "results"
\includegraphics{paste(getwd(), "/", outDir , "/", plotName, "_", i, sep="")}
\ENDFOR

\end{document}

我收到一些错误：

第25行：未定义的控制顺序。第29行：插入了缺少的$。第29行：LaTeX错误：找不到文件`paste（getwd（），“ /”，outDir，“ /”，plotName，“ _”，i，sep =“”）'。第29行：插入了缺少的$。第30行：未定义的控制顺序。

任何帮助，不胜感激！

编辑1：我考虑了Alex A.的建议，并更改了该部分以使其包含\ Sexpr {}表达式，如下所示：

\FOR{i in 1:5}
\Sexpr{nPlots=i}
\Sexpr{plotName = "thePlot"}
\Sexpr{outDir = "results"}
\includegraphics{\Sexpr{paste(getwd(), "/", outDir , "/", plotName, "_", i, sep="")}}
\ENDFOR

\end{document}

但是，我现在收到一个错误：

object 'i' not found

我尝试更改for循环中的条件，使其也包含\ Sexpr {}，如下所示：

\FOR{\Sexpr{i in 1:5}}

但是这使我出错：

Unexpected 'in'

感谢您的任何帮助！

编辑2：

我尝试考虑建议，只是将for循环和图像插入Rcode中。因此，我尝试使用jpeg库及其readJPEG方法，如下所示：

<<echo=FALSE>>==
library(jpeg)
@

<<plots, echo = FALSE, fig = TRUE, figs.only = TRUE, results = hide>>=
for (i in 1:5){
  nPlots=i
  plotName = "thePlot"
  outDir = "results"

  img <- readJPEG(paste(getwd(), "/", outDir , "/", plotName, "_", i, ".jpg", sep=""))
  plot(img)
}
@

\end{document}

不幸的是，这仍然会导致错误：

unexpected 'in'

此外，当我单独运行以下代码时（不在for循环或.Rnw文件中：]]

  nPlots=1
  plotName = "thePlot"
  outDir = "results"

  img <- readJPEG(paste(getwd(), "/", outDir , "/", plotName, "_", i, ".jpg", sep=""))
  plot(img)
生成的图像与我拥有的.jpeg图像看起来不同（位于currentDirectory / results / thePlot_1.jpg中）

我存储了五张图像，如下所示（其中“ currentDirectory”是我从命令getwd（）获得的结果）：currentDirectory / results / thePlot_1.jpg currentDirectory / results / thePlot_2.jpg ...

Answer 1

来自the Sweave Manual：

Answer 2

对于任何可能尝试使用乳胶和编织图像循环的人，我都会进行绘图。像这样：