有没有办法通过合并重复项和标记非重复项将多行解析为单行?

问题描述 投票:1回答:1

我在格式化这样的列表时遇到了问题:

问题:

XYZ gene1
XYZ gene2
GHE ATG01
GHE ATG02

目标(制表符分隔的空格):

XYZ gene1 gene2
GHE ATG01 ATG02

我尝试了ruby -F -ane '$F[1].split(/\t/).each {|x|print [$F [0],x,$F[2]]*"\t"xargspaste命令,但后来陷入困境,弄清楚它是如何工作的,并且ruby命令是制作多行,而不是单行。我也是命令行文本处理的新手。

这就是我实际处理的内容(以及更多内容):

14-3-3 proteins AT1G22300
14-3-3 proteins AT1G26480
14-3-3 proteins AT1G34760
14-3-3 proteins AT1G35160
ZIK subfamily AT1G64630
ZIK subfamily AT3G04910
ZIK subfamily AT3G18750

我希望得到这个:

14-3-3 proteins AT1G22300 AT1G26480 AT1G34760 AT1G35160
ZIK subfamily AT1G64630 AT3G04910 AT3G18750

这就是我得到的:

xargs -a <some_file> | sed 's/ /,/g'
14-3-3,proteins,AT1G22300,14-3-3,proteins,AT1G26480,14-3-3,proteins,AT1G34760,14-3-3,proteins,AT1G35160,14-3-3,proteins,AT1G78220,14-3-3,proteins,AT1G78300,14-3-3,proteins,AT2G42590,14-3-3,proteins,AT3G02520,14-3-3,proteins
text-processing command-line-parsing
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与米勒(https://github.com/johnkerl/miller/releases/tag/5.4.0

mlr --nidx --ofs "\t" nest --nested-fs " " --implode --values --across-records -f 3 input.csv

你有(制表符作为字段分隔符,空格作为嵌套值的字段分隔符)

14-3-3  proteins        AT1G22300 AT1G26480 AT1G34760 AT1G35160
ZIK     subfamily       AT1G64630 AT3G04910 AT3G18750

作为输入我使用了这个(空格分隔)

14-3-3 proteins AT1G22300
14-3-3 proteins AT1G26480
14-3-3 proteins AT1G34760
14-3-3 proteins AT1G35160
ZIK subfamily AT1G64630
ZIK subfamily AT3G04910
ZIK subfamily AT3G18750
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