如何检查Pandas DataFrame中的任何值是否为NaN

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在Python Pandas中,检查DataFrame是否具有一个(或多个)NaN值的最佳方法是什么?

我知道函数pd.isnan,但这会为每个元素返回一个布尔数据框架。 This post就在这里也没有完全回答我的问题。

python pandas dataframe nan
16个回答
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jwilner的回应是现货。我正在探索是否有更快的选择,因为根据我的经验,求平面阵列(奇怪地)比计数更快。这段代码似乎更快:

df.isnull().values.any()

例如:

In [2]: df = pd.DataFrame(np.random.randn(1000,1000))

In [3]: df[df > 0.9] = pd.np.nan

In [4]: %timeit df.isnull().any().any()
100 loops, best of 3: 14.7 ms per loop

In [5]: %timeit df.isnull().values.sum()
100 loops, best of 3: 2.15 ms per loop

In [6]: %timeit df.isnull().sum().sum()
100 loops, best of 3: 18 ms per loop

In [7]: %timeit df.isnull().values.any()
1000 loops, best of 3: 948 µs per loop

df.isnull().sum().sum()有点慢,但当然还有其他信息 - NaNs的数量。


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Super Simple Syntax: df.isna().any(axis=None)

Starting from v0.23.2,你可以使用DataFrame.isna + DataFrame.any(axis=None),其中axis=None指定整个DataFrame的逻辑缩减。

# Setup
df = pd.DataFrame({'A': [1, 2, np.nan], 'B' : [np.nan, 4, 5]})
df
     A    B
0  1.0  NaN
1  2.0  4.0
2  NaN  5.0

df.isna()

       A      B
0  False   True
1  False  False
2   True  False

df.isna().any(axis=None)
# True

Useful Alternatives

numpy.isnan 如果你正在运行旧版本的熊猫,那么另一个高性能选项。

np.isnan(df.values)

array([[False,  True],
       [False, False],
       [ True, False]])

np.isnan(df.values).any()
# True

或者,检查总和:

np.isnan(df.values).sum()
# 2

np.isnan(df.values).sum() > 0
# True

Series.hasnans 你也可以迭代地调用Series.hasnans。例如,要检查单个列是否具有NaN,

df['A'].hasnans
# True

要检查是否有任何列具有NaN,您可以使用any(这是一种短路操作)的理解。

any(df[c].hasnans for c in df)
# True

这实际上非常快。


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这是另一种有趣的方法,即找到null并用计算值替换

    #Creating the DataFrame

    testdf = pd.DataFrame({'Tenure':[1,2,3,4,5],'Monthly':[10,20,30,40,50],'Yearly':[10,40,np.nan,np.nan,250]})
    >>> testdf2
       Monthly  Tenure  Yearly
    0       10       1    10.0
    1       20       2    40.0
    2       30       3     NaN
    3       40       4     NaN
    4       50       5   250.0

    #Identifying the rows with empty columns
    nan_rows = testdf2[testdf2['Yearly'].isnull()]
    >>> nan_rows
       Monthly  Tenure  Yearly
    2       30       3     NaN
    3       40       4     NaN

    #Getting the rows# into a list
    >>> index = list(nan_rows.index)
    >>> index
    [2, 3]

    # Replacing null values with calculated value
    >>> for i in index:
        testdf2['Yearly'][i] = testdf2['Monthly'][i] * testdf2['Tenure'][i]
    >>> testdf2
       Monthly  Tenure  Yearly
    0       10       1    10.0
    1       20       2    40.0
    2       30       3    90.0
    3       40       4   160.0
    4       50       5   250.0

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我一直在使用以下内容并将其类型转换为字符串并检查nan值

   (str(df.at[index, 'column']) == 'nan')

这允许我检查一系列中的特定值,而不仅仅是在系列中某处包含它时返回。


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或者你可以在.info()上使用DF,例如:

df.info(null_counts=True)返回列中的non_null行数,例如:

<class 'pandas.core.frame.DataFrame'>
Int64Index: 3276314 entries, 0 to 3276313
Data columns (total 10 columns):
n_matches                          3276314 non-null int64
avg_pic_distance                   3276314 non-null float64

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df.apply(axis=0, func=lambda x : any(pd.isnull(x)))

如果每个列包含Nan,则检查每个列。


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最好的方法是使用:

df.isna().any().any()

这是why。所以isna()用于定义isnull(),但这两者当然是相同的。

这甚至比接受的答案更快,涵盖了所有2D熊猫阵列。


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df.isnull()。sum()这将为您提供DataFrame中所有NaN值的计数


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df成为Pandas DataFrame的名称,任何numpy.nan值都是空值。

  1. 如果你想看哪些列有空值而哪些列没有(只有True和False) df.isnull().any()
  2. 如果您只想查看具有空值的列 df.loc[:, df.isnull().any()].columns
  3. 如果要查看列中的空值计数 df.loc[:, list(df.loc[:, df.isnull().any()].columns)].isnull().sum()
  4. 如果要查看列中空值的百分比 df.loc[:,list(df.loc[:,df.isnull().any()].columns)].isnull().sum()/(len(air_price))*100

编辑1:如果您想要在视觉上看到数据丢失的位置: import missingno missingdata_df = df.columns[df.isnull().any()].tolist() missingno.matrix(df[missingdata_df])


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根据您正在处理的数据类型,您还可以通过将dropna设置为False来获取执行EDA时每列的值计数。

for col in df:
   print df[col].value_counts(dropna=False)

适用于分类变量,而不是在有许多唯一值时。


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你有几个选择。

import pandas as pd
import numpy as np

df = pd.DataFrame(np.random.randn(10,6))
# Make a few areas have NaN values
df.iloc[1:3,1] = np.nan
df.iloc[5,3] = np.nan
df.iloc[7:9,5] = np.nan

现在数据框看起来像这样:

          0         1         2         3         4         5
0  0.520113  0.884000  1.260966 -0.236597  0.312972 -0.196281
1 -0.837552       NaN  0.143017  0.862355  0.346550  0.842952
2 -0.452595       NaN -0.420790  0.456215  1.203459  0.527425
3  0.317503 -0.917042  1.780938 -1.584102  0.432745  0.389797
4 -0.722852  1.704820 -0.113821 -1.466458  0.083002  0.011722
5 -0.622851 -0.251935 -1.498837       NaN  1.098323  0.273814
6  0.329585  0.075312 -0.690209 -3.807924  0.489317 -0.841368
7 -1.123433 -1.187496  1.868894 -2.046456 -0.949718       NaN
8  1.133880 -0.110447  0.050385 -1.158387  0.188222       NaN
9 -0.513741  1.196259  0.704537  0.982395 -0.585040 -1.693810
  • 选项1:df.isnull().any().any() - 返回一个布尔值

你知道isnull()会返回一个这样的数据帧:

       0      1      2      3      4      5
0  False  False  False  False  False  False
1  False   True  False  False  False  False
2  False   True  False  False  False  False
3  False  False  False  False  False  False
4  False  False  False  False  False  False
5  False  False  False   True  False  False
6  False  False  False  False  False  False
7  False  False  False  False  False   True
8  False  False  False  False  False   True
9  False  False  False  False  False  False

如果你使它成为df.isnull().any(),你可以找到具有NaN值的列:

0    False
1     True
2    False
3     True
4    False
5     True
dtype: bool

还有一个.any()会告诉你,如果上面的任何一个是True

> df.isnull().any().any()
True
  • 选项2:df.isnull().sum().sum() - 返回NaN值总数的整数:

这与.any().any()的运行方式相同,首先给出一列中NaN值的总和,然后是这些值的总和:

df.isnull().sum()
0    0
1    2
2    0
3    1
4    0
5    2
dtype: int64

最后,要获取DataFrame中NaN值的总数:

df.isnull().sum().sum()
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要找出特定列中哪些行具有NaN:

nan_rows = df[df['name column'].isnull()]

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如果你需要知道“一个或多个NaNs”有多少行:

df.isnull().T.any().T.sum()

或者,如果您需要提取这些行并检查它们:

nan_rows = df[df.isnull().T.any().T]

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df.isnull().any().any()应该这样做。


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添加到Hobs的精彩回答,我对Python和Pandas都很陌生,所以请指出我是不是错了。

要找出哪些行具有NaN:

nan_rows = df[df.isnull().any(1)]

通过将any()的轴指定为1来检查行中是否存在“True”,将执行相同的操作而无需转置。


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由于没有提到,只有另一个变量叫做hasnans

如果熊猫系列中的一个或多个值为NaN,df[i].hasnans将输出到True,如果不是,则输出False。请注意,它不是一个功能。

熊猫版'0.19.2'和'0.20.2'


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由于pandas必须为DataFrame.dropna()找到这个,我看了看他们是如何实现它的,并发现他们使用了DataFrame.count(),它计算了DataFrame中的所有非空值。参看pandas source code。我没有对这种技术进行基准测试,但我认为图书馆的作者可能已经做了明智的选择。


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只使用math.isnan(x),如果x是NaN(不是数字),则返回True,否则返回False。

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