如何使用sparklyr添加jar？

Question

当我尝试使用此代码使用Rstudio和sparklyr访问Hive表时：

library(sparklyr)
library(dplyr)
Sys.setenv(SPARK_HOME="/usr/hdp/current/spark2-client") # got from ambari spark2 configs
sc <- spark_connect(master = "yarn-client", config = config, version = '2.1.0')

library(DBI)
tabTweets <- dbGetQuery(sc, "SELECT * FROM tweets0 LIMIT 10")

我收到此错误：

Error in value[[3L]](cond) : 
  Failed to fetch data: java.lang.RuntimeException: java.lang.ClassNotFoundException: org.openx.data.jsonserde.JsonSerDe

这是因为tweets0是使用JsonSerDe创建的。例如，当遇到使用Hive CLI时，它很容易修复：

Add jar /usr/hdp/2.4.2.0-258/hive/lib/json-serde-1.3.7-jar-with-dependencies.jar;

那么我如何使用sparklyr做一个等效的添加jar？

编辑：我试过这个：

spark_dependencies <- function(spark_version, scala_version, ...) {
  sparklyr::spark_dependency(
    jars = c(
      system.file(
        sprintf("/usr/hdp/2.4.2.0-258/hive/lib/json-serde-1.3.7-jar-with-dependencies.jar"),
    package = "JsonSerDe"
      )
    )
  )
}
.onLoad <- function(libname, pkgname) {
  sparklyr::register_extension(pkgname)
}

library(JsonSerDe)

但仍然相同的错误和库（JsonSerDe）给出：

Error in library(JsonSerDe) : there is no package called ‘JsonSerDe’

我在Spark日志中没有看到添加依赖项的任何内容。

Answer 1

你可以使用spark配置提供jar。以下为我们工作。

config[["sparklyr.jars.default"]] <- "/usr/lib/jars/json-serde-1.3.7-jar-with-dependencies.jar"

要么

config[["sparklyr.jars.default"]] <- "hdfs://master.royble.co.uk:8020/jars/json-serde-1.3.7-jar-with-dependencies.jar“

Answer 2

问题不是一个闪闪发光的问题：它是tez.lib.uris中的一个环境。将其更改为：

/hdp/apps/${hdp.version}/tez/tez.tar.gz,hdfs://master.royble.co.uk:8020/jars/json-serde-1.3.7-jar-with-dependencies.jar

（注意：逗号和hdfs路径后没有空格）。但问题是：

Error in library(JsonSerDe) : there is no package called ‘JsonSerDe’

仍然站着，我会接受答案。