Mariadb加载，但几分钟后崩溃。从“快照”恢复服务器后发生的事情

问题描述 投票：1回答：2

我有一个托管OVH的VPS（Ubuntu Server 18.04）。它们提供快照，应该能够将VPS回滚到先前的状态。我之前从未使用过这个功能。但是在我开始搞乱BTCpay之前，我昨晚做了一个快照。我皇家安排了这个安装，所以我决定回滚到快照。

现在我的Mariadb安装工作不正常。服务器上唯一托管的是Wordpress多站点。如果我重新启动服务器（或使用systemctl启动Mariadb），它会加载，我可以访问我的所有wordpress站点和管理面板。但几分钟后，Mariadb崩溃了。

运行mysqld_safe --skip-grant-tables输出：

190308 15:10:20 mysqld_safe Logging to syslog.
190308 15:10:20 mysqld_safe Starting mysqld daemon with databases from /var/lib/mysql

这使Wordpress启动并运行，但显然不是一个安全的解决方案。

这些是在/var/log/mysql/error.log中显示的唯一错误，但只有一个条目，并且每次Mariadb崩溃时它们都不会重复：

2019-03-08 13:08:24 139897840925824 [ERROR] mysqld: Table './mysql/db' is marked as crashed and should be repaired
2019-03-08 13:08:24 139897840925824 [ERROR] mysql.db: 1 client is using or hasn't closed the table properly

和CHECK TABLE mysql.db;输出：

+----------+-------+----------+----------+
| Table    | Op    | Msg_type | Msg_text |
+----------+-------+----------+----------+
| mysql.db | check | status   | OK       |
+----------+-------+----------+----------+
1 row in set (0.00 sec)

到目前为止，我采取的步骤是：

  • 将mysqldump用于'wordpress'数据库，这是我为Wordpress多站点安装设置的数据库。
  • 运行#mysqlcheck --all-databases，回复所有'OK'
  • 在使用mysqld_safe启动Mariadb之后尝试了这里列出的修复https://stackoverflow.com/a/3322930/8644833 --skip-grant-tables

我对mysql不太满意，所以我只是在寻找一种解决方案让我重新启动并运行而不会丢失太多数据。我不介意执行Mariadb的干净安装并设置一个新的Wordpress数据库，但我不确定如何备份我的所有数据，所以我不必重建我的所有网站。似乎这应该是可能的，因为这些网站一切正常，直到Mariadb崩溃。

以下是我拥有的所有其他相关信息：

dmesg的：

[  108.430534] audit: type=1400 audit(1552073977.631:19): apparmor="DENIED" operation="sendmsg" info="Failed name lookup - disconnected path" error=-13 profile="/usr/sbin/mysqld" name="run/systemd/notify" pid=939 comm="mysqld" requested_mask="w" denied_mask="w" fsuid=111 ouid=0
[  108.534100] audit: type=1400 audit(1552073977.739:20): apparmor="DENIED" operation="sendmsg" info="Failed name lookup - disconnected path" error=-13 profile="/usr/sbin/mysqld" name="run/systemd/notify" pid=939 comm="mysqld" requested_mask="w" denied_mask="w" fsuid=111 ouid=0
[  108.634399] audit: type=1400 audit(1552073977.839:21): apparmor="DENIED" operation="sendmsg" info="Failed name lookup - disconnected path" error=-13 profile="/usr/sbin/mysqld" name="run/systemd/notify" pid=939 comm="mysqld" requested_mask="w" denied_mask="w" fsuid=111 ouid=0
[  108.734779] audit: type=1400 audit(1552073977.939:22): apparmor="DENIED" operation="sendmsg" info="Failed name lookup - disconnected path" error=-13 profile="/usr/sbin/mysqld" name="run/systemd/notify" pid=939 comm="mysqld" requested_mask="w" denied_mask="w" fsuid=111 ouid=0
[  108.835027] audit: type=1400 audit(1552073978.039:23): apparmor="DENIED" operation="sendmsg" info="Failed name lookup - disconnected path" error=-13 profile="/usr/sbin/mysqld" name="run/systemd/notify" pid=939 comm="mysqld" requested_mask="w"denied_mask="w" fsuid=111 ouid=0
[  108.935311] audit: type=1400 audit(1552073978.139:24): apparmor="DENIED" operation="sendmsg" info="Failed name lookup - disconnected path" error=-13 profile="/usr/sbin/mysqld" name="run/systemd/notify" pid=939 comm="mysqld" requested_mask="w" denied_mask="w" fsuid=111 ouid=0
[  109.035562] audit: type=1400 audit(1552073978.235:25): apparmor="DENIED" operation="sendmsg" info="Failed name lookup - disconnected path" error=-13 profile="/usr/sbin/mysqld" name="run/systemd/notify" pid=939 comm="mysqld" requested_mask="w" denied_mask="w" fsuid=111 ouid=0
[  109.136162] audit: type=1400 audit(1552073978.339:26): apparmor="DENIED" operation="sendmsg" info="Failed name lookup - disconnected path" error=-13 profile="/usr/sbin/mysqld" name="run/systemd/notify" pid=939 comm="mysqld" requested_mask="w" denied_mask="w" fsuid=111 ouid=0
[  110.038191] audit: type=1400 audit(1552073979.243:27): apparmor="DENIED" operation="sendmsg" info="Failed name lookup - disconnected path" error=-13 profile="/usr/sbin/mysqld" name="run/systemd/notify" pid=939 comm="mysqld" requested_mask="w" denied_mask="w" fsuid=111 ouid=0
[  110.040919] audit: type=1400 audit(1552073979.243:28): apparmor="DENIED" operation="sendmsg" info="Failed name lookup - disconnected path" error=-13 profile="/usr/sbin/mysqld" name="run/systemd/notify" pid=939 comm="mysqld" requested_mask="w" denied_mask="w" fsuid=111 ouid=0

systemctl status mariadb.service：

    ● mariadb.service - MariaDB 10.1.38 database server
   Loaded: loaded (/lib/systemd/system/mariadb.service; enabled; vendor preset: enabled)
   Active: failed (Result: timeout) since Fri 2019-03-08 14:39:39 EST; 14min ago
     Docs: man:mysqld(8)
           https://mariadb.com/kb/en/library/systemd/
  Process: 939 ExecStart=/usr/sbin/mysqld $MYSQLD_OPTS $_WSREP_NEW_CLUSTER $_WSREP_START_POSITION (code=exited, status=0/SUCCESS)
  Process: 839 ExecStartPre=/bin/sh -c [ ! -e /usr/bin/galera_recovery ] && VAR= ||   VAR=`/usr/bin/galera_recovery`; [ $? -eq 0 ]   && systemctl set-environment _WSREP_START_POSITION=$VAR || exit 1 (code=exited, status=0/SUCCESS)
  Process: 809 ExecStartPre=/bin/sh -c systemctl unset-environment _WSREP_START_POSITION (code=exited, status=0/SUCCESS)
  Process: 770 ExecStartPre=/usr/bin/install -m 755 -o mysql -g root -d /var/run/mysqld (code=exited, status=0/SUCCESS)
 Main PID: 939 (code=exited, status=0/SUCCESS)

Mar 08 14:38:08 mydomain.com systemd[1]: Starting MariaDB 10.1.38 database server...
Mar 08 14:38:09 mydomain.com mysqld[939]: 2019-03-08 14:38:09 140251492867200 [Note] /usr/sbin/mysqld (mysqld 10.1.38-MariaDB-0ubuntu0.18.04.1) starting as process 939 ...
Mar 08 14:39:37 mydomain.com systemd[1]: mariadb.service: Start operation timed out. Terminating.
Mar 08 14:39:39 mydomain.com systemd[1]: mariadb.service: Failed with result 'timeout'.
Mar 08 14:39:39 mydomain.com systemd[1]: Failed to start MariaDB 10.1.38 database server.

mysql日志：

2019-03-08 14:59:39 140597857991808 [Note] InnoDB: innodb_empty_free_list_algor
ithm has been changed to legacy because of small buffer pool size. In order to 
use backoff, increase buffer pool at least up to 20MB.

2019-03-08 14:59:39 140597857991808 [Note] InnoDB: Using mutexes to ref count b
uffer pool pages
2019-03-08 14:59:39 140597857991808 [Note] InnoDB: The InnoDB memory heap is disabled
2019-03-08 14:59:39 140597857991808 [Note] InnoDB: Mutexes and rw_locks use GCC atomic builtins
2019-03-08 14:59:39 140597857991808 [Note] InnoDB: GCC builtin __atomic_thread_fence() is used for memory barrier
2019-03-08 14:59:39 140597857991808 [Note] InnoDB: Compressed tables use zlib 1.2.11
2019-03-08 14:59:39 140597857991808 [Note] InnoDB: Using Linux native AIO
2019-03-08 14:59:39 140597857991808 [Note] InnoDB: Using SSE crc32 instructions
2019-03-08 14:59:39 140597857991808 [Note] InnoDB: Initializing buffer pool, size = 128.0M
2019-03-08 14:59:39 140597857991808 [Note] InnoDB: Completed initialization of buffer pool
2019-03-08 14:59:39 140597857991808 [Note] InnoDB: Highest supported file format is Barracuda.
2019-03-08 14:59:39 140597857991808 [Note] InnoDB: 128 rollback segment(s) are active.
2019-03-08 14:59:39 140597857991808 [Note] InnoDB: Waiting for purge to start
2019-03-08 14:59:39 140597857991808 [Note] InnoDB:  Percona XtraDB (http://www.percona.com) 5.6.42-84.2 started; log sequence number 446057526
2019-03-08 14:59:39 140597857991808 [Note] Plugin 'FEEDBACK' is disabled.
2019-03-08 14:59:39 140597201463040 [Note] InnoDB: Dumping buffer pool(s) not yet started
2019-03-08 14:59:39 140597857991808 [Note] Server socket created on IP: '127.0.0.1'.
2019-03-08 14:59:39 140597857991808 [Note] /usr/sbin/mysqld: ready for connections.
Version: '10.1.38-MariaDB-0ubuntu0.18.04.1'  socket: '/var/run/mysqld/mysqld.sock'  port: 3306  Ubuntu 18.04
2019-03-08 15:01:09 140597856737024 [Note] /usr/sbin/mysqld: Normal shutdown
2019-03-08 15:01:09 140597856737024 [Note] Event Scheduler: Purging the queue. 0 events
2019-03-08 15:01:09 140597251774208 [Note] InnoDB: FTS optimize thread exiting.
2019-03-08 15:01:09 140597856737024 [Note] InnoDB: Starting shutdown...
2019-03-08 15:01:09 140597856737024 [Note] InnoDB: Waiting for page_cleaner to finish flushing of buffer pool
2019-03-08 15:01:11 140597856737024 [Note] InnoDB: Shutdown completed; log sequence number 446281568
2019-03-08 15:01:11 140597856737024 [Note] /usr/sbin/mysqld: Shutdown complete
mysql wordpress ubuntu mariadb vps
2个回答
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如果可以，我会发表评论，但我认为这太重要了，不能完全跳过。

服务器快照和数据库备份是不同的东西。问题是快照可能会捕获数据库服务器;如果以后根据快照重新启动系统，数据库服务器可能会混淆。很可能需要几分钟才能在潜伏的不一致和崩溃中绊倒。据推测，重新安装间接启动了比平时更具侵略性的清理，从而消除了不一致性。有关详细信息，并确认我的假设，您可以尝试https://dba.stackexchange.com/。

展望未来，除了系统快照之外，最好还是进行常规数据库备份。在创建快照时，将WordPress置于只读模式（这并不简单，但有一个插件）也可能有效。 （虽然询问这是否有效是合理的。）

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我仍然不知道这个问题的根本原因是什么，但是 卸载并重新安装Mariadb解决了这个问题 。

具体来说我做了：

# apt-get remove --purge mariadb-server
# apt-get autoremove --purge
# apt-get autoclean

出现提示时，我选择保留现有数据库。

然后我重新安装了Mariadb

# apt-get install mariadb-server

在此之后 一切正常，我不需要恢复任何数据库 。

上面的步骤不起作用

完成上述操作后，一切都会正常工作，直到重新启动系统或重新启动mariadb-server。然后原始问题将再次出现，并且mariadb服务器在正常运行一分钟左右后会崩溃。

我还是不知道问题是什么。我知道从快照中恢复是造成这个问题的原因，但我不知道为什么Mariadb会以什么方式破坏。我甚至尝试删除mariadb-server和所有数据库，但是当它重新安装时我会遇到同样的问题。

我厌倦了尝试寻找问题所以我抛弃了wordpress数据库，删除了mariadb-server和所有数据库，并安装了mysql-server。这解决了这个问题。

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