Python NetworkX以节点为根在节点图中查找子图

Question

我正在编写一个代码来从有向图中提取信息。该图也有周期。例如，

A->B->C->D
A->E->F->A
B->F->G

从这个图中，我想创建一个子图或节点列表，其中输入将是任何节点，输出将是输入节点是根的图形，或者是具有所有节点的节点的列表。来自输入节点的子节点（直到图的末尾）

例如，在上面的例子中，1。如果输入节点是C，输出将是D 2.如果输入节点是B，输出节点将是C，D，F，G，A（因为有一个循环，使A到B双向）3。如果输入为G，则输出为空或空。

python networkx中是否有任何功能，我可以用来解决这个问题？

或者，还有其他工具可以帮助我解决这个问题吗？

Answer 1

你想要的是功能dfs_preorder_nodes()。这是一个基于您的数据的小演示：

import networkx as nx

g = nx.DiGraph()

g.add_edge('A', 'B')
g.add_edge('B', 'C')
g.add_edge('C', 'D')

g.add_edge('A', 'E')
g.add_edge('E', 'F')
g.add_edge('F', 'A')

g.add_edge('B', 'F')
g.add_edge('F', 'G')

print('A:', list(nx.dfs_preorder_nodes(g, 'A')))
print('B:', list(nx.dfs_preorder_nodes(g, 'B')))
print('G:', list(nx.dfs_preorder_nodes(g, 'G')))

输出：

A: ['A', 'B', 'C', 'D', 'F', 'G', 'E']
B: ['B', 'C', 'D', 'F', 'A', 'E', 'G']
G: ['G']

输出包括起始节点。因此，如果您不想要它，只需从列表中删除第一个元素即可。

请注意，dfs_preorder_nodes()返回一个生成器对象。这就是为什么我打电话给list()以获得可用的输出。

Answer 2

nx.ego_graph()正是你所描述的。使用@Hai Vu给出的例子：

g = nx.DiGraph()

g.add_edge('A', 'B')
g.add_edge('B', 'C')
g.add_edge('C', 'D')
g.add_edge('A', 'E')
g.add_edge('E', 'F')
g.add_edge('F', 'A')
g.add_edge('B', 'F')
g.add_edge('F', 'G')

a = nx.ego_graph(g, 'A', radius=100)
a.node
#out: NodeView(('A', 'B', 'C', 'D', 'E', 'F', 'G'))

list(nx.ego_graph(g, 'G', radius=100).node)
#out: ['G']

radius应该是一个任意大的数字，如果你想得到树中的所有节点直到叶子。