我在应用程序中启用了UIFilesharingEnabled选项，将其设置为true，但这同时公开了我的文档文件和sqlite.db文件。
然后如何限制显示/访问我的数据库文件给用户或其他应用程序？
您应该看一下Apple File System Basics。您可以在此处找到有关在哪里编写应用程序文件的所有信息：
图书馆
这是不是用户数据的任何文件的顶级目录文件。您通常将文件放入几种标准之一子目录。 iOS应用通常使用应用支持和缓存子目录；但是，您可以创建自定义子目录。对于不想公开的任何文件，请使用“库”子目录用户。您的应用不应将这些目录用于用户数据文件。库目录的内容（除了缓存子目录）由iTunes和iCloud备份。对于有关库目录及其通常的附加信息使用的子目录，请参阅特定于库的目录存储文件。
您可以检查此post如何访问应用程序捆绑包中的库目录