www-data 用户无法导入已安装的 python 模块

Question

我正在尝试创建一个网络服务器，它最终使用以下命令从 PHP 代码调用 python 脚本（“MyScript.py”）

echo exec("MyScript.py ....some arguments")

MyScript.py 实际上包含使用 RDkit 和其他模块（如 numpy）的代码。
当我从用户（MKT）运行这个 MyScript.py 时......它就像一个魅力。

但是当它从服务器的 PHP 脚本执行时，问题就出现了。 /var/www/log/apache2/error.log中的错误信息如下：

ImportError: No module named rdkit
Traceback (most recent call last):
File "./preditar/preditar.py", line 7, in <module>
from rdkit import Chem

我的 rdkit 安装在 /opt/RDKit_2013_06_1/rdkit/ 中，如果从 MKT 用户运行它们，结果如下

MKT@mypc$ python -v

然后在python环境中：

import rdkit

这是输出：

import rdkit # precompiled from /opt/RDKit_2013_06_1/rdkit/\__init__.pyc

我认为执行此操作的用户 www-data 无权访问此模块...那么如何在 MyScript.py 中导入它？？？

注意：当我将 MyScript.py 修改为一个简单的脚本（仅创建一个文件并向其写入数据）时...它可以正常工作，没有任何问题，这意味着我没有任何与权限相关的问题。

Answer 1

看起来像 Python 导入搜索路径有问题。尝试像这样更改导入：

import sys
sys.path.insert(0, "/opt/RDKit_2013_06_1")
import rdkit

Answer 2

通过 sys.path.insert 将用户 ubuntu 找到的缺失路径添加到用户 www-data 不可扩展，也不可能（因为 www-data 用户无法访问 ubuntu 用户路径），因此最好的方法是安装python 模块（在本例中为 rdkit）以 www-data 用户可以访问的方式

sudo mkdir /var/www/.local

sudo mkdir /var/www/.cache

sudo chown www-data:www-data /var/www/.local

sudo chown www-data:www-data /var/www/.cache

sudo -H -u www-data pip install rdkit