[python笔记本中的某些行运行时内核不断死机并重新启动

Question

我收到错误->

/apps/anaconda3/bin/python: symbol lookup error: /apps/anaconda3/lib/python3.6/site-packages/mkl/../../../libmkl_intel_thread.so: undefined symbol: omp_get_num_procs

为了解决此问题，我尝试通过执行“ conda update mkl”来更新mkl软件包，然后重新启动jupyterhub服务。但是，问题仍然存在。

libmkl_intel_thread.so文件位于以下路径-

/apps/anaconda3/envs/myEnv/lib/libmkl_intel_thread.so
/apps/anaconda3/lib/libmkl_intel_thread.so
/apps/anaconda3/pkgs/mkl-2017.0.1-0/lib/libmkl_intel_thread.so
/apps/anaconda3/pkgs/mkl-2019.4-243/lib/libmkl_intel_thread.so

我的$ PATH是->

/apps/anaconda3/envs/myEnv/bin:/apps/anaconda3/condabin:/apps/anaconda3/bin:/opt/mssql-tools/bin:/apps/anaconda3/lib/python3.6/site-packages:/apps/anaconda3/envs/myEnv:/apps/anaconda3/envs/myEnv/bin:/apps/anaconda3/bin:/usr/local/bin:/sbin:/bin:/usr/sbin:/usr/bin

可能有什么问题？

Answer 1

好像您缺少libiomp5.so。除了更新，您还可以运行conda update intel-openmp吗？还要确保文件在您的LD_LIBRARY_PATH中。看一下这个错误报告：github.com/ContinuumIO/anaconda-issues/issues/10195