在travis-ci构建中查找/指定gdal的安装路径

Question

在我正在维护的包中（https://github.com/lbusett/MODIStsp），我使用gdalUtils包作为gdal实用程序的包装器。问题是我找不到在TRAVIS-CI上运行我的测试套件和示例的方法。这似乎与路径上找不到gdal安装文件夹有关，因此我收到以下错误：

gdalUtils :: gdal_setInstallation中的警告（ignore.full_scan = TRUE） 未找到GDAL安装。请在继续之前安装'gdal'： - www.gdal.org（没有HDF4支持！） - www.trac.osgeo.org/osgeo4w/（推荐HDF4支持） - www.fwtools.maptools.org（支持HDF4）

（有关完整构建日志，请参阅此处：https://travis-ci.org/lbusett/MODIStsp/jobs/318037312）

gdalUtils::gdal_setInstallation()应该首先使用sys.which（）来搜索有效的gdal安装，并且（看起来失败）查看“典型”安装路径（请参阅https://www.rdocumentation.org/packages/gdalUtils/versions/2.0.1.7/topics/gdal_setInstallation）。

除了使用以下travis.yml配置在构建中的travis上安装gdal（显然）之外，还会发生这种情况：

{
  "language": "r",
  "cache": "packages",
  "warnings_are_errors": false,
  "before_install": [
    "sudo add-apt-repository ppa:ubuntugis/ubuntugis-unstable --yes",
    "sudo add-apt-repository -y ppa:opencpu/jq --yes",
    "sudo apt-get -qq update",
    "sudo apt-get install -y libgdal-dev libproj-dev",
    "export DISPLAY=:99.0",
    "sh -e /etc/init.d/xvfb start"
  ],
  "group": "stable",
  "dist": "trusty",
  "apt_packages": [
    "libgdal-dev",
    "libproj-dev",
    "libcairo2-dev",
    "libatk1.0-dev",
    "libpango1.0-dev",
    "libgtk2.0-dev",
    "libglib2.0-dev",
    "libcurl4-openssl-dev"
  ],
  "env": "global=[\"R_LIBS=\\\"http://cran.rstudio.com\\\"\", \"R_BUILD_ARGS=\\\"--no-build-vignettes --no-manual\\\"\", \"R_CHECK_ARGS=\\\"--no-build-vignettes --no-manual --as-cran\\\"\", \"R_CHECK_TIMINGS_=\\\"0\\\"\", \"BOOTSTRAP_LATEX=\\\"1\\\"\"]",
  "os": "linux",
  "r_binary_packages": [
    "cairoDevice",
    "RGtk2"
  ],
  "sudo": "required"
}

您有什么建议可以解决这个问题吗？我是否需要以某种方式在travis.yml脚本中将PATH设置为gdal？如果是这样，我怎么能找到安装gdal的位置？ （我尝试在yml中添加像"PATH=\"/usr/local/gdal/bin:$PATH\""这样的行，但它没有用。

在此先感谢您的帮助！

Answer 1

最后，只需在yaml槽中添加gdal-bin的安装即可解决问题：

sudo apt-get install -y gdal-bin

（感谢Benjamin在r-pkg-devel邮件列表中提供解决方案）