我正在尝试运行Docker容器来分析Google Cloud Bucket中的数据。
我已经能够使用gcsfuse成功安装Bucket，我测试了我可以做一些事情，比如在Bucket中创建和删除文件。
为了能够安装其他程序（并安装存储桶），我安装了Docker（并没有使用Docker优化的实例选项）。如果我以交互模式运行Docker（没有安装驱动器），它看起来好像正常。
但是，如果我尝试使用已安装的驱动器（这是挂载gcsfuse的Bucket）以交互模式运行Docker，我会收到一条错误消息：
user@instance:~/bucket-name/subfolder$ docker run -it -v /home/user/bucket-name:/mnt/bucket-name gcr.io/deepvariant-docker/deepvariant
docker: Error response from daemon: error while creating mount source path '/home/user/bucket-name': mkdir /home/user/bucket-name: file exists.
我希望我接近这个工作：有没有人对这个错误消息的相对简单的修复有任何想法？
顺便说一句，我意识到还有其他方法可以在Google Cloud上运行DeepVariant，但我正在努力使事情与我在AWS上做的事情尽可能相似（另外，我可能需要做一些额外的故障排除来分析其中一个我的文件）。
非常感谢您的帮助！
仅供参考，这就是我安装水桶的方式：
#mount directory: https://github.com/GoogleCloudPlatform/gcsfuse/blob/master/docs/installing.md
export GCSFUSE_REPO=gcsfuse-`lsb_release -c -s`
echo "deb http://packages.cloud.google.com/apt $GCSFUSE_REPO main" | sudo tee /etc/apt/sources.list.d/gcsfuse.list
curl https://packages.cloud.google.com/apt/doc/apt-key.gpg | sudo apt-key add -
sudo apt-get update
sudo apt-get -y install gcsfuse
#restart and mount directory: https://cloud.google.com/storage/docs/gcs-fuse
#NOTE: please make sure you are in your home directory (I encounter issues if I try to mount from /mnt)
mkdir [bucket-name]
gcsfuse --file-mode 777 --dir-mode 777 [bucket-name] ./[bucket-name]
这就是我安装Docker的方式：
#install Docker for Debian: https://docs.docker.com/install/linux/docker-ce/debian/
sudo apt-get update
sudo apt-get -y install \
apt-transport-https \
ca-certificates \
curl \
gnupg2 \
software-properties-common
curl -fsSL https://download.docker.com/linux/debian/gpg | sudo apt-key add -
sudo add-apt-repository \
"deb [arch=amd64] https://download.docker.com/linux/debian \
$(lsb_release -cs) \
stable"
sudo apt-get update
sudo apt-get -y --allow-unauthenticated install docker-ce docker-ce-cli containerd.io
#fix Docker sock issue: https://stackoverflow.com/questions/47854463/got-permission-denied-while-trying-to-connect-to-the-docker-daemon-socket-at-uni
sudo usermod -a -G docker [user]
#have to restart after this
我想我至少找到了解决问题的部分方法：
正如this tutorial中提到的，你还需要运行gcloud auth configure-docker。
我发现您还需要退出并重新启动您的实例，但这严格解决了此帖子的原始错误消息。
我想有一个奇怪的消息，但也许更多的是关于特定的容器。所以，我又跑了另一个测试：
docker run -it -v /home/user/bucket-name:/mnt/bucket-name cwarden45/dnaseq-dependencies
这一次，我收到了关于实例上存储空间的错误消息（为了能够下载并运行Docker容器）。所以，我回去创建了一个带有更大本地硬盘的新实例：
1）在Google云端控制台中，我选择了“计算实例”和“VM实例”
2）我点击了“创建实例”（类似于之前）
3）我在“启动盘”下选择“更改”
4）我将大小设置为300 GB而不是10 GB（目前，在“尺寸（GB）”下向右下方）
与之前类似，我为“机器类型”选择了8个vCPU，我在“身份和API访问”下选择了“允许对所有云API的完全访问”，并且我选中了“允许HTTP流量”和“允许HTTPS流量”的复选框“（在”防火墙“下）。
我没有选择“将容器映像部署到此VM实例”，我相信我是如何使用“sudo”安装Docker以便能够安装gcsfuse的。
我还必须将其称为“部分”解决方案，因为这允许我在交互模式下成功运行Docker容器，但挂载的存储桶在Docker中显示为空。
对于另一个项目，我注意到如果我将它们安装在/ opt下的本地硬盘驱动器上，可执行文件可以工作，但如果我尝试将它们安装在我的存储桶上则不行（为了每次都节省这些程序的安装时间）。在AWS上，我认为我需要使用EFS存储而不是S3存储来做类似的事情，但我会继续学习如何使用Google Cloud Bucket进行安装存储/分析。
此外，这是一个不同的问题，但我注意到我可以修复从桶中运行exectuable文件的问题，从gcsfuse [bucket-name] ./[bucket-name]更改命令到gcsfuse --file-mode 777 --dir-mode 777 [bucket-name] ./[bucket-name]（我相应地更改了示例代码）