Cytoscape 中相对距离的细胞邻域分析

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是否可以通过 cytoscape 中定义的分数来显示相对距离的邻域分析?举个例子:2=不在直接邻域中,1=在直接邻域中,0=随机排列。

取较大的值是非常好的,我也会在我的分析中实现这一点。不幸的是,我仍然不清楚应该使用哪种方法来可视化相对距离。根据我所读到的内容,“力导向”范式应该是我分析的最佳解决方案。有人同意吗? 预先感谢并致以最诚挚的问候约书亚

cytoscape
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当然,你当然可以做类似的事情。真正的问题是您希望网络是什么样子?如果您试图通过使用相对距离来查看某种聚类效果,我会使用不同的数字 - 也许 100 = 不在直接邻域中,1 = 在直接邻域中,空白表示随机排列。如果您想将相对距离用于其他用途(例如边缘类型或颜色),那么缩放应该不重要。

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