如何读取LZF压缩的HDF5数据集？

Question

我正在尝试读取具有以下属性的数据集：

我正在为Visual Studio 2017使用HDF5编译的静态库。我一直主要使用C ++ API，并且在读取非压缩数据集时没有问题。在这种情况下，我应该如何读取LZF压缩数据集？

Answer 1

您需要构建lzf过滤器并将其提供给HDF5。h5py repo具有一些有关如何执行此操作的信息。

基本上，您需要克隆h5py存储库，将lzf过滤器构建为共享库，然后将其放入/ usr / local / hdf5 / lib / plugin，并可选地将环境变量指向该位置：

git clone https://github.com/h5py/h5py.git
cd h5py/lzf && gcc -O2 -fPIC -shared lzf/*.c lzf_filter.c -o liblzf_filter.so
mkdir -p /usr/local/hdf5/lib/plugin
cp liblzf_filter.so /usr/local/hdf5/lib/plugin

然后您可以使用h5dumpdataset.hdf5对其进行测试。如果正确检测到并加载了lzf过滤器，则应转储压缩数据集的内容。如果不是，它将显示错误。