GML 渲染不正确，其中多个节点具有相同的标签但 id 值不同

Question

Cytoscape 版本：3.9.1

操作系统：Mac_OS_X_10.16

Java版本：11.0.6

GML 代码

graph [
 node [
  id 8026
  label "DB00094"
  graphics [
   fill "#a6cee3"
  ]
 ]
 node [
  id 8027
  label "A"
  graphics [
   fill "#b2df8a"
  ]
 ]
 node [
  id 8028
  label "B"
  graphics [
   fill "#b2df8a"
  ]
 ]
 node [
  id 8029
  label "A"
  graphics [
   fill "#b2df8a"
  ]
 ]
 node [
  id 8030
  label "A"
  graphics [
   fill "#b2df8a"
  ]
 ]
 edge [
  label "label"
  source 8026
  target 8027
  graphics [
   type "line"
   arrow "last"
  ]
 ]
 edge [
  label "synonyms"
  source 8026
  target 8028
  graphics [
   type "line"
   arrow "last"
  ]
 ]
 edge [
  label "synonyms"
  source 8026
  target 8029
  graphics [
   type "line"
   arrow "last"
  ]
 ]
 edge [
  label "description"
  source 8026
  target 8030
  graphics [
   type "line"
   arrow "last"
  ]
 ]
]

描述具有相同标签（“A”）但不同 id 值的三个节点的图；这三个节点是三个不同边的目标，其源是同一个节点。 Cytoscape 似乎忽略了带有标签“A”的三个节点是不同的，并将三个边指向带有标签“A”的一个目标节点，同时将其他两个节点隔离 - 参见下图：

其他图形工具可以正确渲染 GML 文件：

• Gephi 0.9.7 (https://gephi.org/)：见下图：
• yEd 3.22（https://www.yworks.com/products/yed）：见下图：

我对 Cytoscape 做错了什么吗？

Answer 1

不——这是我们读取源和目标属性的方式中的一个错误。我们（错误地）假设标签是唯一的。我建议发布一个错误，我们将在下一个版本中修复它。