查询时SPARQL命名空间冲突

Question

我对端点的行为以及请求的处理感到非常困惑。基本的 RDFS 命名空间在查询时似乎与另一个定义发生冲突，导致声明前缀时出错，而在正文中省略前缀时导致正常输出。

设置

查询1：

SELECT *
WHERE {
  ?sub rdfs:label ?p .
} LIMIT 5

输出1：

INFO:root:                                             sub                   p         
0  http://example.org/triples/17bbab96          Pont d Iéna-9423efbc
1  http://example.org/triples/37d3fba1          Pont d Iéna-9423efbc
2  http://example.org/triples/e8a8921a          Pont Transbordeur-fb62b01e
3  http://example.org/triples/7907d1de          Pont Transbordeur-fb62b01e
4  http://example.org/triples/5b529b5e          Pont d Iéna-98cdd2fc

查询2：

PREFIX rdfs: <http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#>
SELECT *
WHERE {
  ?sub rdfs:label ?p .
} LIMIT 5

输出2（客户端）：

(...)
raise HTTPError(req.full_url, code, msg, hdrs, fp)
urllib.error.HTTPError: HTTP Error 400: Bad Request
(...)
ValueError: You did something wrong formulating either the URI or your SPARQL query

输出2（服务器端）：

[INFO ] 2023-07-13 08:50:13,797 [repositories/astra1 | c.o.f.s.GraphDBProtocolExceptionResolver] X-Request-Id: 712a09f4-626e-5f2a-b22b-5d436e2c4ae2 Client sent bad request (400)
org.eclipse.rdf4j.http.server.ClientHTTPException: MALFORMED QUERY: Multiple prefix declarations for prefix 'rdfs'

在 graphdb 端点 (rdf4j) 上使用 rdflib 进行查询

import os
import logging
logger = logging.getLogger()
logger.setLevel(logging.DEBUG)

from dotenv import load_dotenv
load_dotenv()

from rdflib import Graph
from rdflib.plugins.stores import sparqlstore
from rdflib.plugins.sparql.processor import SPARQLResult

from requests.auth import HTTPDigestAuth

from pandas import DataFrame

def sparql_results_to_df(results: SPARQLResult) -> DataFrame:
    """
    Export results from an rdflib SPARQL query into a `pandas.DataFrame`,
    using Python types. See https://github.com/RDFLib/rdflib/issues/1179.
    """
    return DataFrame(
        data=([None if x is None else x.toPython() for x in row] for row in results),
        columns=[str(x) for x in results.vars],
    )


if __name__ == '__main__':
  store = sparqlstore.SPARQLUpdateStore(query_endpoint=os.environ['SPARQL_ENDPOINT_QUERY'], update_endpoint=os.environ['SPARQL_ENDPOINT_UPDATE']) #,
                          # auth=HTTPDigestAuth(config.AUTH_USER, config.AUTH_PASS), context_aware=True,

  g = Graph(store=store, identifier=os.environ['SPARQL_DEFAULT_NAMED_GRAPH_FULL_URI']) # namespace_manager=None

  q_sa ="""
    select * where { 
      ?s ?p ?o .
    } limit 20 
    """
  
  q_sa2 = """
    PREFIX rdfs: <http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#>
    SELECT *
    WHERE {
      ?sub rdfs:label ?p .
    } LIMIT 20
  """
  
  qr = g.query(q_sa2)
  df = sparql_results_to_df(qr)
  logging.info(df)
  

期待

我的预期恰恰相反，查询 1 在引发“未定义前缀错误”时失败，查询 2 检索我的结果。 有没有办法通过修改客户端或服务器端的某些内容来实现这种行为？这是一个坏主意吗 ？ （我更喜欢查询中包含所有内容，甚至是最基本的命名空间）

我很高兴读到您对此的想法。 预先感谢您的回答！

Answer 1

谢谢@UninformedUser，你让我走上了正轨！很难弄清楚错误在哪里触发（rdflib 的图表？ sparqlstore ？ 端点配置？）

唉，空的

initNs

不起作用，因为它在源中被默认的图形命名空间覆盖：

initNs = initNs or dict(self.namespaces())  # noqa: N806

查看 RDFLIB 文档中的命名空间绑定，每个图都附带默认命名空间。

然后，解决方案是覆盖默认的图形配置：

g = Graph(store=store, identifier=os.environ['SPARQL_DEFAULT_NAMED_GRAPH_FULL_URI'], bind_namespaces="none")

解决了！ （2天后标记）