如何通过Pandoc＆Knitr从Rmarkdown访问MathJax扩展（如siunitx）？

Question

使用Rmarkdown和Rstudio在pandoc中使用knitr，我使用MathJax通过LaTeX和HTML输出来定位PDF输出。我想使用一些可用的MathJax扩展，以便为PDF目标提供更丰富的LaTeX。具体来说，我现在正试图使用​​siunitx扩展，虽然我也对其他人感兴趣（例如physics）。

使用siunitx可以很好地使用LaTeX进行PDF输出，但是我很难使用HTML输出。

这是一个示例Rmarkdown文件：

---
title: "siunitx test"
author: "chriss"
date: "June 13, 2017"
output:
  html_document:
    mathjax: https://cdn.rawgit.com/mathjax/MathJax/2.7.1/latest.js?config=TeX-AMS-MML_HTMLorMML
    number_sections: yes
  pdf_document:
    keep_tex: yes
    latex_engine: xelatex
    number_sections: yes
header-includes: \usepackage{siunitx}
---

```{r setup, include=FALSE}
knitr::opts_chunk$set(echo = TRUE)
```

# The Problem

I would like to be able to use `siunitx` latex macros from `Rmarkdown`,
targetting PDF output via latex and html with MathJax. It should get me proper
formatting of things like $\SI{120}{\W\per\square\m}$ and $\SI{0.8}{\A\per\W}$,
as long as I put them in a latex math environment, so that MathJax picks them
up.

The PDF output is OK when I add the `header-includes: \usepackage{siunitx}` to
the `YAML` header, but how can I access the MathJax `siunitx` extension via the
knitr -> pandoc -> mathjax/html route?

Check: is MathJax working in general: $\frac{1}{r^2}$

这样可以很好地编写PDF，但$\SI{}{}$在HTML输出和RStudio中逐字输出红色。我有pandoc从MathJax获得rawgit.org，因为cdn.mathjax.org的默认值很快就会失效，而且似乎不再有扩展的Contrib路径。

我试过添加MathJax的$\require{siunitx}$与siunitx扩展的路径的变化，无济于事。这导致HTML寻找siunitx扩展，但显然在错误的地方：https://cdn.rawgit.com/mathjax/MathJax/2.7.1/extensions/TeX/siunitx.js?V=2.7.1，这是一个404。

如果我删除\require{}并删除动态加载MathJax的输出HTML文件的部分（标记为<!-- dynamically load mathjax for compatibility with self-contained -->），并手动添加：

<script type="text/x-mathjax-config">
  MathJax.Hub.Config({
    tex2jax: {inlineMath: [["$","$"],["\\(","\\)"]]},
  errorSettings: {message: undefined},
    TeX: { extensions: ["[burnpanck]/siunitx/unpacked/siunitx.js"] }
  };
  MathJax.Ajax.config.path['burnpanck']  = 
'https://rawgit.com/burnpanck/MathJax-third-party-extensions/master';
</script>
<script type="text/javascript" 
src="https://cdn.rawgit.com/mathjax/MathJax/2.7.1/latest.js?config=TeX-AMS-
MML_HTMLorMML"></script>

对于HTML文件的标题，然后它简要地弹出一个关于siunitx.js的一些问题的抱怨，但产生正确的输出（这是来自siunitx的here MathJax扩展的示例的标题的修改版本）

这表明我可以修改pandoc的HTML模板来反映这些变化，事情基本上可行。

但是，仍存在以下问题：

• 以这种方式更改HTML模板是修复HTML输出的正确方法吗？这些是现在用于cdn.mathjax.org的网址，还是我应该使用的更好的网址？
• 为什么我仍然会收到关于siunitx.js的警告？
• 要让Rstudio在预览中了解siunitx内容需要做些什么？有没有办法启用这个（例如说服它使用siunitx扩展，假设它是建立在MathJax上），或者这是一个功能请求..？

事实上，如果有一个简单的方法来访问开箱即用的MathJax扩展，而不必去编辑模板之类的麻烦，并在Rstudio GUI中正确处理，那将是很好的。我可以想象可能会有Rstudio用户从额外的功能中受益，但不希望/无法跳过这些箍来访问它。

更新我在加载关于siunitx.js的'工作'HTML时看到的警告消息似乎是当前版本的siunitx.js的一般问题，由于MathJax CDN的更改，请参阅此处提出的问题：https://github.com/burnpanck/MathJax-third-party-extensions/issues/5

Answer 1

我正在使用包含in_header来解决问题。

---
title: "doku1"
output:
  html_document:
    includes:
     in_header: header.html
  pdf_document:
    keep_tex: yes
    latex_engine: pdflatex
    number_sections: no
header-includes: \usepackage{mhchem, siunitx}
---

header.html看起来像这样

<script type="text/x-mathjax-config">
MathJax.Ajax.config.path["mhchem"] = "https://cdnjs.cloudflare.com/ajax/libs/mathjax-mhchem/3.3.2";
MathJax.Ajax.config.path['myExt']  = 'https://rawgit.com/burnpanck/MathJax-third-party-extensions/master';
MathJax.Hub.Config({
  TeX: { extensions: ["AMSmath.js","AMSsymbols.js","[myExt]/siunitx/unpacked/siunitx.js","[mhchem]/mhchem.js", "color.js"] }
  });
</script>

它有效，但速度很慢。

约翰