我如何创建一个依赖于Rcpp共享库的R包?

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我有一个从libbcd.so源代码生成的共享库C。我也有一些接口代码Rinterface.h, Rinterface.cpp,如下所示:

Rinterface.h

#pragma once

#include <R.h>
#include <Rcpp.h>
extern "C" {
#include "bcd.h"
}

void call_bcd();

Rinterface.cpp

#include "Rinterface.h"

// [[Rcpp::export]]
void call_bcd() {
    mm_problem* pr = mm_problem_alloc();
    bcd_vars* vars = bcd_vars_alloc();
    bcd(pr, vars);
}

mm_problem_alloc(), bcd_vars_alloc(), bcd(mm_problem*, bcd_vars*)libbcd.so中的所有函数,mm_problembcd_varslibbcd.so中的用户定义类型。

我用Rcpp.package.skeleton("bcd")创建了一个程序包,将Rinterface文件放在src文件夹下,并带有以下Makevars

PKG_CPPFLAGS=-I/usr/local/lib/R/site-library/Rcpp/include/ -I/path/to/bcd/headers/
PKG_LIBS=-L/path/to/bcd/library/file -lbcd
  • 我可以使用R CMD SHLIB Rinterface.cpp创建接口库
  • 我也可以使用R CMD build .建立打包的tarball>
  • [如果我在编译步骤后尝试使用install.packages("/path/to/bcd_1.0.tar.gz", type = "source")从源代码安装软件包,则在尝试加载libbcd.so时出现错误:

** R
** byte-compile and prepare package for lazy loading
** help
*** installing help indices
** building package indices
** testing if installed package can be loaded from temporary location
Error: package or namespace load failed for ‘bcd’ in dyn.load(file, DLLpath = DLLpath, ...):
 unable to load shared object '/home/gomfy/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/00LOCK-bcd/00new/bcd/libs/bcd.so':
  libbcd.so: cannot open shared object file: No such file or directory

基于this post,在我看来,一种解决方法是将.clibbcd.so源文件重命名为.cpp,然后将它们放在src文件夹中。这是正确的吗?

[通常,推荐使用Rcpp来从R调用第三方共享库的方法是什么?我发现了一个相关的问题here,但没有涉及构建软件包的详细信息。我看过Writing R extensions

vignette("Rcpp-introduction")vignette("Rcpp-package"),但我无法得出明确的结论。因此,在此感谢专家的帮助。谢谢!

我有一个从C源代码生成的共享库libbcd.so。我还有一些接口代码Rinterface.h,Rinterface.cpp,如下所示:Rinterface.h:#pragma一旦#include ...

c r dll rcpp
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总之,你不能。

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