我写了一个使用python一个3.6脚本（蟒蛇rpy2）。 R版本是3.5.1。当我运行importr('Seurat')这是给我的错误：
/Users/kipnislab/anaconda3/envs/rmain/lib/python3.6/site-packages/rpy2/rinterface/init.py:146：RRuntimeWarning：错误：包或命名空间负载失败“修拉”：.onLoad在loadNamespace失败（）为 'hdf5r'，细节：致电：好玩（LIBNAME，PKGNAME）错误：错误检索当前的错误处理程序
从中我看到importr('Seurat')需要进口hdf5r和失败。我在虚拟conda环境中工作。启动R和运行library('Seurat')工作得很好。如果我只是开spyder并运行importr('Seurat')它也工作正常，但在终端上运行时：python seurat_clustering.py失败与上述错误。我安装hdf5r使用conda和也在里面R，但它并没有帮助。如果我在importr('hdf5r')运行spyder它提供了一个有趣的警告，可能是这里重要的（虽然不是错误，因此它实际上加载罚款）：
/Users/kipnislab/anaconda3/envs/rmain/lib/python3.6/site-packages/rpy2/rinterface/init.py:146：RRuntimeWarning：错误：延迟加载数据库“/用户/ kipnislab / anaconda3 / ENVS / rmain /lib/R/library/hdf5r/R/hdf5r.rdb”是腐败
更新
现在的问题仍然没有得到解决，但我发现这里的问题。下面接连做一个进口导致的问题：
import hdf5
from rpy2.robjects.packages import importr
seuratLib = importr('Seurat')
所以，一个文件导入hdf5打开文件并加载正确的数据，但我无法导入，因为那Seurat。我想应该有进口hdf5之前卸载Seurat的一种方式。
最终，我通过切换进口秩序固定的问题：第一个导入所有的rpy2相关的软件包，然后Seurat，才把h5py（在一个单独的文件，做数据检索）。
from rpy2.robjects.packages import importr
seuratLib = importr('Seurat')
import nice_service as ns
里面nice_service的我import hdf5