SPARQL查询不起作用 - SNOMED-CT本体

Question

我正在尝试执行一个非常简单的SPARQL查询，使用https://bioportal.bioontology.org/ontologies/SNOMEDCT/?p=classes&conceptid=root（在Java中）根据查询字符串中传递的名称检索有关特定疾病的信息，我不明白为什么它不起作用。以下是相关代码：

PREFIX rdfs: <http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#>

SELECT DISTINCT *
FROM <http://bioportal.bioontology.org/ontologies/SNOMEDCT>
FROM <http://bioportal.bioontology.org/ontologies/globals>
WHERE
{
    ?x rdfs:label ?label .
    FILTER (CONTAINS ( UCASE(str(?label)), "MELANOMA") )
}

Answer 1

在BioPortal上SNOMED-CT中唯一出现的rdfs:label是snomed-term: rdfs:label "SNOMEDCT"。相反，BioPortal uses skos:prefLabel（这是subproperty的rdfs:label）。

试试这个查询：

PREFIX skos: <http://www.w3.org/2004/02/skos/core#>
PREFIX snomed-term: <http://purl.bioontology.org/ontology/SNOMEDCT/>

SELECT DISTINCT *
FROM <http://bioportal.bioontology.org/ontologies/SNOMEDCT>
FROM <http://bioportal.bioontology.org/ontologies/globals>
WHERE {
    ?x skos:prefLabel ?label .
    FILTER (CONTAINS ( UCASE(str(?label)), "MELANOMA") )
}

应该有10个结果。

如果您需要将结果限制为疾病，可能您需要在查询中添加?x rdfs:subClassOf+ snomed-term:64572001。但不幸的是，似乎BioPortal SPARQL端点不支持SPARQL 1.1属性路径。