通过字符串列表迭代返回单个字符

Question

我有匹配字典的键在我的计划，3字母串的列表。我想用字典中的每个3字符串翻译，所以我写了一个for循环。相反，在列表中平移每个元素，将其转换在每个3个字母的元素，无所作为，因为在字典中没有对每一个单个字符。我觉得我忘了什么东西基本在for循环和列表，但我无法弄清楚如何得到这个迭代和翻译我多么希望。下面的代码：

rnaCodonTable = {
# RNA codon table
# U
'UUU': 'F', 'UCU': 'S', 'UAU': 'Y', 'UGU': 'C',  # UxU
'UUC': 'F', 'UCC': 'S', 'UAC': 'Y', 'UGC': 'C',  # UxC
'UUA': 'L', 'UCA': 'S', 'UAA': 'STOP', 'UGA': 'STOP',  # UxA
'UUG': 'L', 'UCG': 'S', 'UAG': 'STOP', 'UGG': 'W',  # UxG
# C
'CUU': 'L', 'CCU': 'P', 'CAU': 'H', 'CGU': 'R',  # CxU
'CUC': 'L', 'CCC': 'P', 'CAC': 'H', 'CGC': 'R',  # CxC
'CUA': 'L', 'CCA': 'P', 'CAA': 'Q', 'CGA': 'R',  # CxA
'CUG': 'L', 'CCG': 'P', 'CAG': 'Q', 'CGG': 'R',  # CxG
# A
'AUU': 'I', 'ACU': 'T', 'AAU': 'N', 'AGU': 'S',  # AxU
'AUC': 'I', 'ACC': 'T', 'AAC': 'N', 'AGC': 'S',  # AxC
'AUA': 'I', 'ACA': 'T', 'AAA': 'K', 'AGA': 'R',  # AxA
'AUG': 'M', 'ACG': 'T', 'AAG': 'K', 'AGG': 'R',  # AxG
# G
'GUU': 'V', 'GCU': 'A', 'GAU': 'D', 'GGU': 'G',  # GxU
'GUC': 'V', 'GCC': 'A', 'GAC': 'D', 'GGC': 'G',  # GxC
'GUA': 'V', 'GCA': 'A', 'GAA': 'E', 'GGA': 'G',  # GxA
'GUG': 'V', 'GCG': 'A', 'GAG': 'E', 'GGG': 'G'   # GxG
}
self.aaList = []
self.codonList = ['AUG', 'AGG', 'CUG', 'AAG', 'AUA', 'AGG', 'ACA', 'GAC', 'GGC', 'GCC', 'GCC', 'CAG', 'CAA', 'CAG', 'CAG', 'GCG', 'GAC', 'UGG', 'CGG', 'GAC', 'UGC', 'UUC', 'AUC', 'CGC', 'GCC', 'GUC', 'GUC', 'GAG', 'AUG', 'CCG', 'GCG', 'GAC', 'UGG', 'GGC', 'AUG', 'GCG', 'AUA', 'AUC', 'AAG', 'GCC', 'AUG', 'CCC', 'CAG', 'GAG', 'AUG', 'GUA', 'AAC', 'GAG', 'CUG', 'UUA', 'CAA', 'AGC', 'CGA', 'AAC', 'GAC', 'CCC', 'UAC', 'UAC', 'AAA', 'UUC', 'GCG', 'CUU', 'CUG', 'CUA', 'CUG', 'CAG', 'AGG', 'GCA', 'CAG', 'AAA', 'UAA']
for codon in self.codonList[:]:
        self.aaList += codon.translate(self.rnaCodonTable)
    print (self.aaList)

我期待的输出[“M”，“R”，“L”，...]平移根据字典中的每个3字母串，而是我得到：

['A', 'U', 'G', 'A', 'G', 'G', 'C', 'U', 'G', 'A', 'A', 'G', 'A', 'U', 'A', 'A', 'G', 'G', 'A', 'C', 'A', 'G', 'A', 'C', 'G', 'G', 'C', 'G', 'C', 'C', 'G', 'C', 'C', 'C', 'A', 'G', 'C', 'A', 'A', 'C', 'A', 'G', 'C', 'A', 'G', 'G', 'C', 'G', 'G', 'A', 'C', 'U', 'G', 'G', 'C', 'G', 'G', 'G', 'A', 'C', 'U', 'G', 'C', 'U', 'U', 'C', 'A', 'U', 'C', 'C', 'G', 'C', 'G', 'C', 'C', 'G', 'U', 'C', 'G', 'U', 'C', 'G', 'A', 'G', 'A', 'U', 'G', 'C', 'C', 'G', 'G', 'C', 'G', 'G', 'A', 'C', 'U', 'G', 'G', 'G', 'G', 'C', 'A', 'U', 'G', 'G', 'C', 'G', 'A', 'U', 'A', 'A', 'U', 'C', 'A', 'A', 'G', 'G', 'C', 'C', 'A', 'U', 'G', 'C', 'C', 'C', 'C', 'A', 'G', 'G', 'A', 'G', 'A', 'U', 'G', 'G', 'U', 'A', 'A', 'A', 'C', 'G', 'A', 'G', 'C', 'U', 'G', 'U', 'U', 'A', 'C', 'A', 'A', 'A', 'G', 'C', 'C', 'G', 'A', 'A', 'A', 'C', 'G', 'A', 'C', 'C', 'C', 'C', 'U', 'A', 'C', 'U', 'A', 'C', 'A', 'A', 'A', 'U', 'U', 'C', 'G', 'C', 'G', 'C', 'U', 'U', 'C', 'U', 'G', 'C', 'U', 'A', 'C', 'U', 'G', 'C', 'A', 'G', 'A', 'G', 'G', 'G', 'C', 'A', 'C', 'A', 'G', 'A', 'A', 'A', 'U', 'A', 'A']

如何使译文影响列表中整个字符串，而不是字符串的每个字符？

Answer 1

我删除了所有的异体为了简单起见，你接近，你的迭代是正确的，但你需要遍历列表中的每个对象。

然后使用该对象找到你所定义的字典中的相应值。修正了打印您的压痕这是不正确的。

你也并不需要使用翻译，我用追加到值添加到结果列表。

希望帮助:)

rnaCodonTable = {
# RNA codon table
# U
'UUU': 'F', 'UCU': 'S', 'UAU': 'Y', 'UGU': 'C',  # UxU
'UUC': 'F', 'UCC': 'S', 'UAC': 'Y', 'UGC': 'C',  # UxC
'UUA': 'L', 'UCA': 'S', 'UAA': 'STOP', 'UGA': 'STOP',  # UxA
'UUG': 'L', 'UCG': 'S', 'UAG': 'STOP', 'UGG': 'W',  # UxG
# C
'CUU': 'L', 'CCU': 'P', 'CAU': 'H', 'CGU': 'R',  # CxU
'CUC': 'L', 'CCC': 'P', 'CAC': 'H', 'CGC': 'R',  # CxC
'CUA': 'L', 'CCA': 'P', 'CAA': 'Q', 'CGA': 'R',  # CxA
'CUG': 'L', 'CCG': 'P', 'CAG': 'Q', 'CGG': 'R',  # CxG
# A
'AUU': 'I', 'ACU': 'T', 'AAU': 'N', 'AGU': 'S',  # AxU
'AUC': 'I', 'ACC': 'T', 'AAC': 'N', 'AGC': 'S',  # AxC
'AUA': 'I', 'ACA': 'T', 'AAA': 'K', 'AGA': 'R',  # AxA
'AUG': 'M', 'ACG': 'T', 'AAG': 'K', 'AGG': 'R',  # AxG
# G
'GUU': 'V', 'GCU': 'A', 'GAU': 'D', 'GGU': 'G',  # GxU
'GUC': 'V', 'GCC': 'A', 'GAC': 'D', 'GGC': 'G',  # GxC
'GUA': 'V', 'GCA': 'A', 'GAA': 'E', 'GGA': 'G',  # GxA
'GUG': 'V', 'GCG': 'A', 'GAG': 'E', 'GGG': 'G'   # GxG
}

aaList = []
codonList = ['AUG', 'AGG', 'CUG', 'AAG', 'AUA', 'AGG', 'ACA', 'GAC', 'GGC', 'GCC', 'GCC', 'CAG', 'CAA', 'CAG', 'CAG', 'GCG', 'GAC', 'UGG', 'CGG', 'GAC', 'UGC', 'UUC', 'AUC', 'CGC', 'GCC', 'GUC', 'GUC', 'GAG', 'AUG', 'CCG', 'GCG', 'GAC', 'UGG', 'GGC', 'AUG', 'GCG', 'AUA', 'AUC', 'AAG', 'GCC', 'AUG', 'CCC', 'CAG', 'GAG', 'AUG', 'GUA', 'AAC', 'GAG', 'CUG', 'UUA', 'CAA', 'AGC', 'CGA', 'AAC', 'GAC', 'CCC', 'UAC', 'UAC', 'AAA', 'UUC', 'GCG', 'CUU', 'CUG', 'CUA', 'CUG', 'CAG', 'AGG', 'GCA', 'CAG', 'AAA', 'UAA']
for codon in codonList:
    aaList.append(rnaCodonTable[codon])
print (aaList)

Answer 2

从string.translate文档：

删除从s是在deletechars（如果存在的话）的所有字符，并且然后使用表，必须是256个字符的字符串，给出了翻译的每个字符值，该索引的顺序翻译的字符。如果表是无，则仅进行字符删除步骤。

......这是一件好事，从你在做什么完全不同。这是你应该做的事情：

aaList = ""
for codon in self.codonList:
    self.aaList += self.rnaCodonTable[codon]