无法在datalab笔记本中安装底图包

Question

我正在尝试在需要底图的Google datalab Jupyter笔记本中运行脚本，但我无法安装此软件包。 Yelsayed指出该模块需要几个依赖项，但即使在构建这些模块后也无法安装。

以下是我认为需要安装的依赖项：

!pip install Cython

!apt-get update && apt-get install -y gcc

!pip install pyproj

!pip install GEOS

这些安装没有事件。最后，Yelsayed指出的底图本身需要通过以下方式完成：

!pip install https://downloads.sourceforge.net/project/matplotlib/matplotlib-toolkits/basemap-1.0.7/basemap-1.0.7.tar.gz

这需要一段时间来安装并且似乎显示出承诺，但最终它安装到99％然后输出“已杀死”：

Collecting https://downloads.sourceforge.net/project/matplotlib/matplotlib-toolkits/basemap-1.0.7/basemap-1.0.7.tar.gz
Downloading https://downloads.sourceforge.net/project/matplotlib/matplotlib-toolkits/basemap-1.0.7/basemap-1.0.7.tar.gz (129.7MB)
99% |############################### | 129.7MB 154kB/s eta 0:00:01Killed

最后的“杀戮”似乎表明它最终没有奏效。它可靠地执行此操作，重新尝试上述调用以相同的方式失败。在任何情况下，我都提供了导入模块，但仍然得到相同的错误：

ImportError: No module named basemap

为什么会发生这种情况？如何在此环境中成功安装底图？

Answer 1

由于大小，它看起来不像basemap托管在PyPI上。查看https://github.com/matplotlib/basemap上的安装说明。

您可以使用他们的直接链接v1.0.7：

!pip install https://downloads.sourceforge.net/project/matplotlib/matplotlib-toolkits/basemap-1.0.7/basemap-1.0.7.tar.gz

编辑

以下是安装先决条件的更多细分，在笔记本单元格中运行以下所有内容：

GEOS:

您最好的选择是直接从apt安装它以避免版本问题。你可以做：

%bash
apt-get update && apt-get install -y build-essential libgeos-3.4.2 libgeos-c1 libgeos++-dev

pyproj, pyshp

然后，您可以轻松地使用pip安装python依赖项：

%bash
pip install pyproj pyshp

basemap

然后，您可以使用上面的链接安装底图包：

%bash
!pip install https://downloads.sourceforge.net/project/matplotlib/matplotlib-toolkits/basemap-1.0.7/basemap-1.0.7.tar.gz

然后，您可以导入底图类：

from mpl_toolkits.basemap import Basemap

Answer 2

您可以解决在Google Cloud Datalab Notebook中编写此代码的问题

! apt-get -y --allow-unauthenticated --fix-missing install python-mpltoolkits.basemap python-numpy python-matplotlib

Answer 3

开箱即用的谷歌数据库没有底图。

截至2019年2月，这是一个新的谷歌数据库：

第1步：安装先决条件

• !apt-get update && apt-get install -y --allow-unauthenticated build-essential libgeos-3.5.0 libgeos-c1v5 libgeos++-dev

注意：我尝试了yelsayed的例子，但是我的datalab找不到libgeos-3.4.2，并且在我运行时不推荐使用libgeos-c1。我将这些值更新为3.5.0和c1v5并且它有效。我还必须添加allow unauthenticated标签部分。

• !pip install pyproj pyshp

第2步：安装整个包

• !pip install https://downloads.sourceforge.net/project/matplotlib/matplotlib-toolkits/basemap-1.0.7/basemap-1.0.7.tar.gz

第3步：检查包装是否已正确安装

• !pip freeze

第4步：导入模块

• from mpl_toolkits.basemap import Basemap