如何设置两个条件的for循环

Question

我编写了这个 for 循环来计算 R 代码中 seurat 中的标记。

seurat.integrated$res.01

是

"C0"

到

"C5"

。我需要计算每个簇的标记。 重点是，对于每个周期，我需要更改

list[[]]$gene

的 nr，因为列表中的每个元素对应于一个簇。因此，对于 C0，

list[[]]

的 nr 应为 1，对于 C1 应为 2，依此类推。我怎样才能把它写在循环中？谢谢！

for (i in seurat.integrated$res.01) {
  results <- FindMarkers(seurat.integrated,
                         ident.1 = paste(i, "day4", sep = "_"),
                         ident.2 = paste(i, "day6", sep = "_"),
                         features = list[[]]$gene,
                         logfc.threshold = -Inf,
                         test.use = "wilcox",
                         min.pct = 0.2,
                         min.cells.group = 0,
                         )

  }

Answer 1

没有数据：似乎可以通过使用

which()

获取向量的数字索引来解决问题。

注意：只有当 C0、C1、C2 ... 等每个仅出现一次时，这才按预期工作。

clusters <- c("C0", "C1", "C2", "C3", "C4", "C5")
li <- list(a = "a", b = "b", c = "c", d = "d", e = "e", f = "f")

for (i in clusters) {
  index <- which(clusters == i)
  li[[index]] |> print()
}
#> [1] "a"
#> [1] "b"
#> [1] "c"
#> [1] "d"
#> [1] "e"
#> [1] "f"