使用R package brms时出错

Question

我想使用R包brms，但是我得到了一个我无法解释的错误。它可能与Rtools有关，然而brms安装在我的电脑上。

这是

 fit1 <- brm(count ~ log_Age_c + log_Base4_c * Trt_c 
        + (1|patient) + (1|visit) + (1|obs), 
        data = epilepsy, family = poisson(), 
        prior = c(set_prior("student_t(5,0,10)", class = "b"),
                  set_prior("cauchy(0,2)", class = "sd")))

包中的一个例子：

system("g++ -v")

这是我得到的错误：

compileCode出错（f，代码，语言=语言，详细=详细）： 编译错误，未创建的功能/方法！ c：/ Rtools / mingw_64 / bin / g ++：找不到 make：*** [file202834c75e9.o]错误127 警告信息： l'exécutiondela commande'make -f“C：/PROGRA~1/R/R-33~1.0/etc/x64/Makeconf”-f“C：/PROGRA~1/R/R-33~1.0/ share / make / winshlib.mk“SHLIB_LDFLAGS ='$（SHLIB_CXXLDFLAGS）'SHLIB_LD ='$（SHLIB_CXXLD）'SHLIB =”file202834c75e9.dll“WIN = 64 TCLBIN = 64 OBJECTS =”file202834c75e9.o“'renvoie un statut 2 另外：警告信息： 运行命令'C：/PROGRA~1/R/R-33~1.0/bin/x64/R CMD SHLIB file202834c75e9.cpp 2> file202834c75e9.cpp.err.txt'的状态为1

谢谢你的帮助

Answer 1

实际上，这是Rtools的一个问题。 rstan给你什么？如果它是状态127，则R找不到Rtools。很可能，在Rtools安装期间您没有选中该框，要求您修改系统路径。我建议您解开Rtools并重新安装它，确保选中此框。另请确认您使用的是与R版兼容的正确版本的Rtools。

Answer 2

我在安装

In find_rtools() :

  WARNING: Rtools 3.4 found on the path at c:/Rtools is not compatible with R 3.3.1.

Please download and install Rtools 3.3 from http://cran.r-project.org/bin/windows/Rtools/, remove the incompatible version from your PATH, then run find_rtools().

时遇到了类似的问题。 RTools33出现问题。安装RTools34似乎解决了这个问题，虽然我现在得到以下警告：

R-{version}\etc\x64\Makeconf

到目前为止，这个警告似乎是良性的

Answer 3

如果其他答案都没有解决此问题，请进入您的R发行版并打开

BINPREF

并将第19行的here更改为mingw_64 \ bin目录的路径。

Answer 4

要修复此错误：“c：/ Rtools / mingw_64 / bin / g ++：not found”我找到了C：驱动器上的RBuildTools文件夹，在bin文件夹中找到了g ++文件，复制了mingw_64文件夹（或者你的g ++文件所在的位置）位于），在C：上创建了一个Rtools文件夹并粘贴了mingw_64文件夹。这将创建使用stan（）函数编译R代码所需的C：/ Rtools / mingw_64 / bin /路径。

Answer 5

我在Windows配置上关注了rStan wiki Makevars。

而不是在c：\中黑客攻击here，你可以按照%HOM%\.R\Makevars.win64指令创建你的个人。

在我的qazxswpoi文件中

CXXFLAGS = -O3 -mtune = native -march = native -Wno-unused-variable -Wno-unused-function BINPREF =“H：/ RTools / mingw_64 / bin /”

这解决了我的问题。