ImageJ TIFF导入图像尺寸？

Question

我有一堆使用幻灯片扫描仪（滨松）自动扫描的幻灯片，可以从NDPview软件以不同的放大率导出这些幻灯片。到目前为止，我一直在放大以获得感兴趣的区域的最佳分辨率，并使用NDP视图软件中的本机比例尺选项添加1mm（1000 um）的比例尺。然后，我将NDPview中的“视图”导出到TIFF。然后将此TIFF导入ImageJ（Fiji），在这里我使用绘制的比例尺设置比例。这一直很好，但是要处理500多个图像，这有点麻烦。

由于TIFF导入了具有inchxinch尺寸的ImageJ，所以我认为可以转到Image-> Properties，只需将长度单位更改为um。为了测试这一点，我选择了一个要测量的区域。然后，我将此与我的旧方法进行了比较...值完全不同。知道为什么吗？ 1是旧方法，2是新方法。

我确定要在每次测试之间的比例尺窗口中“移除比例”。整个图像尺寸也不同：

Answer 1

如果图像的放大倍率和分辨率都相同，那么只要您知道测量的距离（以像素为单位）和物理距离（以微米或毫米为单位），就可以使用分析>设置比例。 。

要在宏中执行此操作，可以使用

run("Set Scale...", "distance=255 known=1 pixel=1 unit=micron");

其中255是您已知单位（1微米）的距离（以像素为单位）。如果将该行包装在对所有TIFF进行操作的循环中并保存每个结果图像，则可以将其应用于文件夹中的所有TIFF。