使用字符串选择数据框中的位置来存储值。

Question

我有一个在模型中运行的循环。循环生成多个公式，这些公式被插入到模型命令中，然后使用以下方法进行后向步骤选择处理 buildmer(). 使用 lapply() 函数，它为一个名为Species的列表中的每个数据帧做了这个工作。问题是我需要将结果存储在不同的数据框中，这样才不会让它们混淆。

代码的简化例子是。

lapply(Species, function(x){

  for (i in 1:10){
    LRm<-buildmer(formula = form.LR, family = 'binomial', control=glmerControl(optimizer="bobyqa"), data=x, crit= c('AIC'), direction = c("order", "backward"))


 #Get the species name for current model

  ID<-colnames(DIKDIK) %>%
  .[grepl("ADULTS",.)]%>%
  sub("*.ADULTS", "", .)

 paste0(ID)$AIC[i]<-AIC(LRm)

  }
})

EDIT: form.LR是模型公式，每次迭代都要重新创建 但这段代码被省略了，因为它不相关

很明显，当代码达到x的第二个值时（也就是运行第二个数据帧的模型），结果将被第一个结果所覆盖，因为'i'的索引是相同的。这就是问题所在。

请注意，我可以通过选择与 "ADULTS "部分匹配的colname来确定使用了哪个数据框，使用的是 grepl() 的全列名称在每个数据框中都是唯一的。所以我想我可以用这个字符串来命名每个数据框，即 "GIRAFFE"，并用它来确定数据应该存储在哪里。但我似乎无法找到正确的组合，即 paste(). 我甚至不确定我所做的尝试是否可行。

目前的代码崩溃了，给出的错误是

Error in paste0(ID)[[i]] <- NA : could not find function "paste0<-"

到目前为止，我在SO上没有找到类似问题的其他解决方案。

物种列表对象的一个简化的可复制的例子是

ADULTS.GIRAFFE<-rnorm(20, 3, sd=1)
ADULTS.DIKDIK<-rnorm(20, 3, sd=1)
ADULTS.IMPALA<-rnorm(20, 3, sd=1)

presence1<-rbinom(20, 1, .5)
presence2<-rbinom(20, 1, .5)
presence3<-rbinom(20, 1, .5)

var1<-rnorm(20, 3, sd=1)
var2<-rnorm(20, 3, sd=1)
var3<-rnorm(20, 3, sd=1)

a<-cbind(presence1, var1, var2, var3, ADULTS.GIRAFFE)
b<-cbind(presence1, var1, var2, var3, ADULTS.DIKDIK)
c<-cbind(presence1, var1, var2, var3, ADULTS.IMPALA)

Species<-list(a,b,c)

Answer 1

将数据帧存储为一个列表，我可以将列表中的每个数据帧命名为so。

snames<-c("DIKDIK","THOMSONS", "GIRAFFE", "GRANTS", "IMPALA")

OutsLR<-lapply(snames, function(x){

  x<-data.frame()%>%
    insertRows(., 499, new = NA)%>%
    mutate(Number=NA)%>%
    mutate(AIC=NA)%>%
    mutate(Model=NA)

})

#Rename the data frames in the list
names(Outs) = snames

然后用ID这个字符串对象来选择数据框就很容易了。

#Just for the example
ID<-"DIKDIK"

#Then 
OutsLR[[ID]][["AIC"]][i]<-AIC(LRm)