构建 R 包错误：对象列为导出，但不存在于命名空间中

Question

我正在构建 R 包。最近，我删除并重命名了 R/allFunctions.R 中的几个函数。我以前能够自动更新 NAMESPACE，但由于某种原因，我现在无法这样做，并出现一些错误，如下所示：

library(packageName)
library(roxygen2)
library(devtools)
install()
ERROR: loading failed
* removing ‘/Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.1/Resources/library/packageName’
* restoring previous ‘/Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.1/Resources/library/packageName’
Error: Command failed (1)
document()
Updating packageName documentation
Loading packageName
Warning message:
In setup_ns_exports(pkg, export_all) :
  Objects listed as exports, but not present in namespace: functionOne, functionTwo

我清楚地看到，我有一些名称空间中不存在的对象被列为导出。但是，我删除了 allFunctions.R 文件中的所有 @export。我在 NAMESPACE 中看到一些新命名的函数名称不存在，而一些旧的（自重命名后）函数名称仍然存在。我可以手动更改它，但我知道这很危险，并且想避免那些糟糕的技术。

如果您有任何想法，请告诉我！谢谢。

Answer 1

@jtr13 的答案也对我有用。只需第二次运行

devtools::document()

，警告就会消失。

> devtools::document()
Updating pavm documentation
Loading pavm
Writing NAMESPACE
Deleting evlCalcTime.Rd
Deleting initTimeStamp.Rd
Warning message:
In setup_ns_exports(pkg, export_all) :
Objects listed as exports, but not present in namespace: evlCalcTime, 
initTimeStamp

> devtools::document()
Updating pavm documentation
Loading pavm

Answer 2

我刚刚做了类似的事情：我从 R/allFunctions.R 中删除了 3 个导出函数并运行 devtools::document()。这给了我以下错误：

Warning message:
In setup_ns_exports(pkg, export_all) :
  Objects listed as exports, but not present in namespace: getAccounts, getClients, getDeposits

我通过手动从 NAMESPACE 文件中删除 3 个 export() 函数解决了这个问题。

Answer 3

根据我的经验，这通常是函数定义和 roxygen 语句之间的拼写错误，特别是在涉及驼峰命名法时，例如：

#' @export functionOne
functionone <- function() { ... }

Answer 4

这是一个老问题，但对于发现它的任何人来说：可以通过在函数定义中使用双赋值箭头 (

<<-

) 而不是标准箭头 (

<-

) 来生成此错误（至少在 devtools 2.4 中是这样）。 5 和 roxygen2 7.3.1)