我有一个文件夹。每个文件的名称可以分为三个部分：名称 - 所有文件都相同; key - 一些关键字，根据这些关键字，文件可以分为3组;结束号码（1..10） - 组内的位置。例：
name_key1_1
name_key1_2
name_key1_3
..
name_key1_10
name_key2_1
name_key2_2
name_key2_3
..
name_key2_10
name_key3_1
name_key3_2
name_key3_3
..
name_key3_10
现在我需要循环所有文件，目的是将它们传递给一些程序，该程序组合了来自同一组（密钥）的文件。每次我只需要使用相同的密钥传递文件，以便将它们组合在一起（避免在每次处理期间将文件与其他密钥混合）。因此，有3组文件，应使用以下方法创建三个组合文件：
for file in ${input}/*.xtc; do
file_name=$(basename "$file")
prog -f ${input}/${name}_${key}_* -o ${output}/${name}_${key}_combined.xtc -cat
done
在这个例子中，通过执行prog，我需要组合来自每个组的10个文件（使用相同的密钥），避免与来自另一个组的文件混合。
我将非常感谢这个工作流程的实现及其过滤器的应用，例如基于从文件名中取出的自动检测组的数量。
如果字段由下划线分隔，并且值中没有其他下划线（即所有文件名只包含两个下划线），则只需在下划线上拆分。
for file in ${input}/*.xtc; do
oldIFS=$IFS
IFS=_
set -- ${file#"$input"/}
IFS=$oldIFS
dest="${output}/${1}_${2}_combined.xtc"
test -e "$dest" && continue
prog -f "${input}/${1}_${2}_"{1..10} -o "$dest" -cat
done
命令set -- string在string的值上拆分$IFS并用结果填充位置参数$1，$2，$3等。参数扩展${variable#prefix}返回$variable的值，删除了prefix（如果找到）。
我们粗暴地遍历所有文件，但如果输出文件已经存在，则跳过prog。
如果你需要从末端剥离下划线，可能在循环中有这样的东西：
base=${file%_*}
tail=${file#"$base"}
head=${base%_"$tail"}
dest="$outputdir/${head#$input/}_combined.txt"
test -e "$dest" && continue
:
其中${variable#suffix}删除后缀。
如果您可以重新设计输入的结构，那么组 - 以及它们之前的名称 - 也是子目录，这将使得处理集合时没有任何其他逻辑非常自然和直接。
我建议使用以下代码，假设循环时$ {name}没有改变。
/编辑：由于@tripleee是对的，我们应该使用find而不是ls
#!/bin/bash
input="/tmp/test/"
output="/tmp/"
name="foo"
for key in $(find ${input} -maxdepth 1 -mindepth 1 -type f -printf "%f\n" | rev| cut -d"_" -f2 | rev | sort | uniq ); do
for file in $(find ${input} -maxdepth 1 -mindepth 1 -type f -name \*_${key}_\* -print | sort ); do
prog -f ${file} -o ${output}/${name}_${key}_combined.xtc -cat
done
done