如何使用SimpleITK保存DICOM文件时如何保留UID？

Question

我正在尝试使用SimpleITK读取一个DICOM文件，并将其保存在其他位置。我注意到Series Instance UID会发生变化，无论我是否明确设置它。

如何保留原始UID？

from pathlib import Path
import SimpleITK as sitk

dicom_path = '......'
p = Path(dicom_path)

reader = sitk.ImageFileReader()
reader.SetFileName(str(p))
reader.LoadPrivateTagsOn()

image = reader.Execute()
print('Series Instance UID', image.GetMetaData('0020|000e'))
print('SOP Instance UID', image.GetMetaData('0008|0018'))
image.SetMetaData('0020|000e', image.GetMetaData('0020|000e'))

writer = sitk.ImageFileWriter()
writer.SetFileName(out_folder+case+p.name)
writer.SetUseCompression(False)
writer.Execute(image)

reader = sitk.ImageFileReader()
reader.SetFileName(out_folder+case+p.name)
reader.LoadPrivateTagsOn()

image = reader.Execute()
print('Series Instance UID', image.GetMetaData('0020|000e'))
print('SOP Instance UID', image.GetMetaData('0008|0018'))

为Series UID提供两个不同的字符串。 SOP UID保持不变：

Series Instance UID 1.3.12.2.1107.5.1.4.74141.30000017013107011409700014483
SOP Instance UID 1.3.12.2.1107.5.1.4.74141.30000017013107011409700014570

Series Instance UID 1.2.826.0.1.3680043.2.1125.1.65790274925978549485969544082687134
SOP Instance UID 1.3.12.2.1107.5.1.4.74141.30000017013107011409700014570

Answer 1

尽管我从未使用过该工具包，但该工具包的行为很奇怪。如果修改像素数据，则应更改某些属性；在这种情况下，SOP实例UID最重要。

但是，在您的情况下，像素数据不会被修改。同样，仅修改系列实例UID； SOP实例UID不变。

无论如何，工具包提供了一种在编写DICOM数据集时保留UID的方法。有关更多详细信息，请参考KeepOriginalImageUIDOn成员。

Self＆itk :: simple :: ImageFileWriter :: KeepOriginalImageUIDOn（void）使用原始研究/系列/参考框架。

这些方法设置/获取/切换KeepOriginalImageUID标志，该标志将传递给图像文件的itk :: ImageIO对象。这仅与DICOM文件格式有关，将编写器配置为使用图像的元数据字典中的信息或创建新的参考值研究/系列/框架。

文件sitkImageFileWriter.h的第134行的定义。

这将指示工具包在写入数据集时保留原始UID。