创建本地 R 包存储库

Question

我想创建一个本地 R 包存储库，以便我公司的用户可以从中安装包，系统管理员可以定期更新本地存储库。目前拒绝访问 CRAN 镜像。

有没有简单的方法可以做到这一点？

Answer 1

是的，无论是 CRAN 的副本还是带有本地包的 repo 都很容易设置。大概你想要这个用于 Windows 所以这样做：

1. 在您的网络服务器上创建一个顶级目录，比如

   R/

2. 在那里创建通常的层次结构：

   R/bin/windows/contrib/2.11

   。如果您需要支持其他（早期）版本，只需在

   2.10

   目录旁边创建目录

   2.9

   ，

   2.11

   ，...
3. 将您需要的包放入目录（例如，

   2.11

   ），然后切换到该目录并运行以下命令为存储库生成

   PACKAGES

   和

   PACKAGES.gz

   文件：

   tools::write_PACKAGES(".", type="win.binary")

这就是它的全部内容——现在您可以通过指向给定命令的地址来访问存储库，例如

update.packages(repos="http://my.local.server/R", ask=FALSE) 我什至在

R/zzz.R

 中对本地包进行了更新，以便它们自行更新。

五年后编辑：drat 包现在可以自动执行很多操作，如果您还使用 GitHub 通过 http/https 提供存储库（但对其他或本地托管也很有用），则效果尤其显着。

Answer 2

阅读管理员指南的

部分。

Answer 3

包

miniCRAN也为此提供了很好的功能。关键优势在于您不需要完整镜像，但可以设置 CRAN 的“迷你”镜像，仅包含您需要的包分发，包括它们的依赖项。

Answer 4

我也无权访问 CRAN 镜像来安装包。因此，我发现这些步骤很有用。

首先，您需要确保您的系统中有以下路径及其目录：“/R/src/contrib”。如果您没有此路径和这些目录，则需要创建它们。您所有的 R 包文件都将存储在“contrib”目录中。

将包文件添加到“contrib”目录后，您可以使用

utils

 包中的 

setRepositories 函数来创建存储库。我建议将以下代码添加到您的 .Rprofile 以获取本地存储库：

utils::setRepositories(ind = 0, addURLs = c(WORK = "file://<your higher directories>/R")) 编辑 .Rprofile 后，重新启动 R.

ind = 0

 将表明您只需要本地存储库。 

addURLs =

 选项中可以包含其他存储库，并在字符向量中以逗号分隔。

接下来，使用以下代码创建存储库索引：

tools::write_PACKAGES("/<your higher directories>/R/src/contrib", verbose = TRUE) 这将生成用作存储库索引的 PACKAGE 文件。

要查看您的存储库中有哪些包，请运行以下代码并查看生成的数据框：

my_packages <- available.packages()

此时，您可以从 repo 安装包，而无需引用包安装文件的整个路径。例如，要安装

dplyr 包，您可以运行以下命令：

install.packages("dplyr", dependencies = TRUE) 如果您想更进一步并管理不断变化的存储库，您可以安装和使用

miniCRAN 包。否则，每当您的存储库更改时，您都需要执行write_PACKAGES

功能。

安装

miniCRAN包后，您可以执行以下代码来创建miniCRAN repo：

 my_packages <- available.packages()

 miniCRAN::makeRepo(
  pkgs = my_packages[,1, 
  path = "/<your higher directories>/R",
  repos = getOption("repos"), 
  type = "source",
  Rversion = R.version, 
  download = TRUE, 
  writePACKAGES = TRUE,
  quiet = FALSE
 )

你只需要为每个 repo 执行一次上面的代码。

然后，检查以确保每个 miniCRAN 存储库都已创建。你只需要为每个 repo 做一次：

 pkgAvail(
  repos = getOption("repos"),
  type = "source",
  Rversion = R.version,
  quiet = FALSE
 )

每当新的包文件放入本地仓库时，您可以按如下方式更新本地仓库的索引：

miniCRAN::updateRepoIndex("/<your higher directories>/R/") 最后，作为查看新包是否在索引中的可选步骤，创建可用包的数据框并搜索数据框：

my_packages <- available.packages(repos = "file://<your higher directories>/R/") 这种方法对我来说效果很好，但也许其他人有意见和建议可以改进它。