由于我是R的新手，我不知道S3方法和对象是什么。我发现有S3和S4对象系统，如果可能的话，有些人建议使用S3而不是S4（http://google-styleguide.googlecode.com/svn/trunk/google-r-style.html）。但是，我不知道S3方法/对象的确切定义。
大多数相关信息可以通过查看?S3或?UseMethod找到，但简而言之：
S3指的是方法调度的方案。如果你已经使用了R一段时间，你会注意到有许多不同类型的对象有print，predict和summary方法。
在S3中，这通过以下方式工作：
glm的返回值具有类glm）print），然后是一个点，然后是类名（例如：print.glm）print）做一些准备工作，但是如果你只是想让自己符合现有的方法名称，那么你就不需要这个了（如果你的话，请参阅我之前提到的帮助）做）。对于旁观者的眼睛，特别是新创建的时髦模型拟合包的用户，能够输入predict(myfit, type="class")比predict.mykindoffit(myfit, type="class")更方便。
还有更多，但这应该让你开始。这种基于对象的属性（类）调度方法的方式存在很多缺点（而且纯粹主义者可能会在晚上醒来时很恐怖），但在很多情况下，它的工作正常。使用当前版本的R，已经实现了更新的方法（S4和参考类），但是大多数人仍然（仅）使用S3。
要开始使用S3，请查看median函数的代码。在命令提示符下键入median显示它的主体中有一行，即
UseMethod("median")
这意味着它是一种S3方法。换句话说，您可以为不同的S3类使用不同的median函数。要列出所有可能的中位数方法，请键入
methods(median) #actually not that interesting.
在这种情况下，只有一个方法，即默认值，可以调用任何方法。您可以通过键入来查看该代码
median.default
一个更有趣的例子是print函数，它有许多不同的方法。
methods(print) #very exciting
请注意，某些方法的名称旁边有*s。这意味着它们隐藏在某个包的命名空间中。使用find找出它们所在的包。例如
find("acf") #it's in the stats package
stats:::print.acf
来自http://adv-r.had.co.nz/OO-essentials.html：
R的三个OO系统在定义类和方法方面有所不同：
- S3实现了一种称为泛型函数OO的OO编程风格。这与大多数编程语言不同，例如Java，C ++和C＃，它们实现消息传递OO。通过消息传递，消息（方法）被发送到对象，对象确定要调用的函数。通常，此对象在方法调用中具有特殊外观，通常出现在方法/消息的名称之前：例如， canvas.drawRect（ “蓝”）。 S3是不同的。虽然仍然通过方法执行计算，但是称为泛型函数的特殊类型的函数决定调用哪个方法，例如drawRect（canvas，“blue”）。 S3是一个非常随意的系统。它没有正式的类定义。
- S4与S3的工作方式类似，但更为正式。 S3有两个主要的区别。 S4具有正式的类定义，它描述了每个类的表示和继承，并具有用于定义泛型和方法的特殊辅助函数。 S4也有多个调度，这意味着泛型函数可以根据任意数量的参数类来选择方法，而不仅仅是一个。
- 参考类，简称RC，与S3和S4完全不同。 RC实现消息传递OO，因此方法属于类，而不是函数。 $用于分隔对象和方法，因此方法调用看起来像canvas $ drawRect（“blue”）。 RC对象也是可变的：它们不使用R的通常的复制修改语义，而是在适当的位置进行修改。这使得他们更难以推理，但允许他们解决难以用S3或S4解决的问题。
还有另外一个系统不是OO，但重要的是在这里提一下：
- 基本类型，作为其他OO系统基础的内部C级类型。基本类型主要使用C代码进行操作，但它们很重要，因为它们为其他OO系统提供构建块。
我来到这个问题，主要是想知道名字的来源。从this wikipedia article看来，该名称是指R所基于的S编程语言的版本。其他答案中描述的方法调度方案来自S，并根据版本进行适当标记。
尝试
methods(residuals)
其中列出了“residuals.lm”和“residuals.glm”。这意味着当您拟合线性模型m和residuals(m)类型时，将调用residuals.lm。当您拟合广义线性模型时，将调用residuals.glm。这种C ++对象模型是颠倒的。在C ++中，您定义了一个具有虚函数的基类，这些函数被派生的类重写。在R中，您定义了一个虚拟（也称为通用）函数，然后您决定哪些类将覆盖此函数（也称为定义方法）。请注意，执行此操作的类不需要从一个公共超类派生。我不同意通常更喜欢S3而不是S4。 S4有更多的形式（=更多的打字），这对某些应用来说可能太多了。但是，S4类可以像C ++中的类或结构一样定义。您可以指定某个类的对象由字符串和两个数字组成，例如：
setClass("myClass", representation(label = "character", x = "numeric", y = "numeric"))
使用该类的对象调用的方法可以依赖于具有这些成员的对象。这与S3类非常不同，后者只是一堆元素的列表。
使用S3和S4，您可以通过fun(object, args)而不是object$fun(args)调用成员函数。如果您正在寻找类似后者的东西，请查看proto包。