无法从Github安装 "Velocyto.R"。

Question

我是一个初学者的R试图分析我的scRNA-seq数据与velocyto.R在R工作室.按照velocyto教程，我试图安装velocyto.R如下。

library(devtools)
install_github("velocyto-team/velocyto.R")

但是，弹出了一个错误。

ERROR: compilation failed for package 'velocyto.R'

removing 'C:/Users/USER/Documents/R/win-library/3.6/velocyto.R'
Error: Failed to install 'velocyto.R' from GitHub:
(converted from warning) installation of package ‘C:/Users/USER/AppData/Local/Temp/RtmpukpRFl/file37346a812b86/velocyto.R_0.6.tar.gz’ had non-zero exit status

有没有人遇到上述同样的问题，并成功解决了呢？

我急需帮助！谢谢

Answer 1

正如你的错误日志所说 C:/...你可能使用Windows。根据velocyto的 README 这个软件包似乎只在 unix风味系统 与 C++11, Open MP, boost, igraph 和 hdf5c++ 库。

这可能是问题所在：请阅读velocyto的GitHub问题。#40也许你需要在WSL下运行这个... ?