org.obolibrary.oboformat.parser.OBOFormatParser警告：警告：线：901预期位置的空白：6行：

Question

我正在使用Java项目从文件（dbpedia_2016-10.owl）加载本体，向该本体添加一些公理，然后将其作为新的本体写入.owl文件。稍后在我的项目中，我使用loadOntologyFromOntologyDocument(new File("DBpedia_modified.owl"))中的OWLOntology加载新的本体，并在多行中收到此警告：我注意到解析器对pos 5或pos 6感到不满意，这与字符相对应:：

Jan 04, 2020 12:57:49 PM org.obolibrary.oboformat.parser.OBOFormatParser warn
WARNING: LINE: 84  Expected white space at pos: 5  LINE:
<owl:someValuesFrom rdf:resource="http://dbpedia.org/ontology/MusicGenre"/>
Jan 04, 2020 12:57:49 PM org.obolibrary.oboformat.parser.OBOFormatParser warn
WARNING: LINE: 85  Expected white space at pos: 6  LINE:
</owl:Restriction>

由于我对这个领域还很陌生，所以我不理解为什么解析器期望使用空白而不是:；我的问题是警告有多严重？以及如何解决？我用谷歌搜索，但没有找到适当的答复。

谢谢您的指导。

Answer 1

您可以忽略此警告。您的文件采用RDF格式，并且警告来自OBO解析器。

如果未指定本体使用哪种格式，OWLAPI将尝试所有可用的解析器，直到找到一个接受本体的解析器为止。 OBO解析器拒绝（正确）解析本体，并且还发出警告，这比应该做的要多，因为到那时它应该已经抛出异常。

编辑：为避免使用OBO解析器，您可以选择应使用的格式：

manager.loadOntologyFromOntologyDocument(
        new FileDocumentSource(file, new RDFXMLDocumentFormat()));

这将仅尝试一个解析器（我猜您的文件格式为RDF / XML）。