R 控制台出乎意料地慢，长时间落后于作业（PDF 输出）完成

Question

当我运行大型 R 脚本时（按预期工作得很好，基本上在脚本的end处生成了正确的 PDF（基本绘图加上 beeswarm，脚本的最后一行是

dev.off()

），我注意到 PDF 已完成大约 3 秒后，甚至可以在其他应用程序中打开，早在控制台输出（只有几个整数值和代码的回显 ~ 400 行）完成之前（大约 20 秒）。没有报告任何错误。在这之间，回显停止并且几秒钟内什么也不做。

我在 Win-7 上使用 R Studio V0.97.551、R 版本 3.0.1。

gc() 或关闭并重新启动 R 没有帮助，而且使用的数据结构并不大（5 个数据帧，最多 60 个 obs 和 64 个数字或短字符变量）。可用内存应该足够（根据任务管理器，大约 4 GB），但 CPU 在这段时间很忙。

我同意这对于没有脚本的其他人来说是不可重现的，但是脚本太大而无法发布，但也许有人遇到过同样的问题，甚至解释或建议要检查什么？预先感谢！

编辑： 我直接在 R 3.0.1（没有 RStudio）中运行完全相同的代码，问题消失了，表明问题与 RStudio 有关。我添加了 RStudio 标签，但我不确定现在是否应该将此问题移至其他地方？

Answer 1

最近我遇到了类似的问题——从 RStudio 运行变得非常慢，即使它正在执行像 example('plot') 这样简单的东西。经过一番搜索后，这篇文章为我指出了正确的位置，最终找到了解决方法：通过重命名“RStudio-Desktop Directory”来重置 RStudio。确切的方法取决于您所使用的操作系统，您可以在here找到详细说明。我刚刚尝试了一下，确实有效。

Answer 2

差不多 10 年后了，我在 iMac 上使用 RStudio 时遇到了完全相同的问题。重命名 RStudio-Desktop 目录没有帮助，删除 com.rstudio.desktop 也没有帮助。正如一位人士所建议的那样，删除 MalawareBytes 也没有帮助。清除控制台也没有。

当 RStudio 尝试写入控制台时，某些事情会导致延迟，并且在写入几十行后会发生这种情况。将数据写入控制台日志文件或其他东西似乎需要时间。

还有更多想法吗？