vtk网格生成会改变坐标吗？

Question

我使用python实现的vtk将nifti文件转换为vtk。主要功能是vtkMarchingCubes。

contour=vtk.vtkMarchingCubes() 

结果vtk网格具有适当的形状，但是它们的位置似乎已更改。例如，当我在同一场景中使用不同的管道（freesurfer）将它们完全由相同的nifti图像制成的软垫表面加载时，结果如下所示。

nifti的vtk转换会更改顶点的坐标还是以某种方式“重置”它们？

Answer 1

VTK的MarchingCubes过滤器应在与体积相同的坐标系中产生三角形。唯一的问题是Nifti图像还包括图像的坐标系，而VTK可能未正确使用它。我猜想Nifti中有一个转换，是VTK使用不当。

尝试使用Slicer（slicer.org）或ITK-Snap（itksnap.org）。他们在维护医学图像的坐标系方面做得更好。

Answer 2

是的，VTK在读取nifti时会更改坐标。

-使用GetQFormMatrix（）获取Q矩阵-使用vtkTransform（）转换坐标需要。