尝试安装 spatstat.core 时出错

Question

我有 R 4.3.3，我正在尝试通过 RStudio 使用 phenoptr 来合并/合并/分析 qptiff 文件。当我尝试安装 phenoptr 时，它说我没有 spatstat.core。当我尝试下载 spatstat.core 时，它说该软件包不适用于此版本的 R。下面粘贴了两个错误。

devtools::install_github(“akoyabio/phenoptr”) 下载 GitHub 存储库 akoyabio/phenoptr@HEAD 跳过 1 个软件包不可用：spatstat.core ── R CMD 构建────────────────────────────────────────────── ──────────── ✔ 检查文件 'C:\Users\krcon\AppData\Local\Temp\RtmpUvqT8r emotes847c67818ab koyabio-phenoptr-7d5dcea/描述' (658ms) ─ 准备“phenoptr”：（1.8s） ✔ 检查描述元信息... ─ 检查源文件、make 文件和 shell 脚本中的 LF 行结尾（360 毫秒） ─ 检查空目录或不需要的目录 ─ 构建“phenoptr_0.3.2.tar.gz”

将软件包安装到“C:/Users/krcon/AppData/Local/R/win-library/4.3” （因为“lib”未指定） 错误：依赖项“spatstat.core”不可用于包“phenoptr”

• 删除“C:/Users/krcon/AppData/Local/R/win-library/4.3/phenoptr” 警告信息： 在 i.p(...) 中： 软件包“C:/Users/krcon/AppData/Local/Temp/RtmpUvqT8r/file847c26d57dbb/phenoptr_0.3.2.tar.gz”的安装具有非零退出状态

install.packages(“spatstat.core”) 将软件包安装到“C:/Users/krcon/AppData/Local/R/win-library/4.3” （因为“lib”未指定） install.packages 中的警告： 软件包“spatstat.core”不适用于此版本的 R

我尝试从网站上找到的 zip 文件下载 spatstat.core： https://cran.r-project.org/web/packages/spatstat/index.html

但是，我不知道下载 spatstat 的后续步骤

Answer 1

spatstat.core

不再存在。它已被两个软件包

spatstat.explore

和

spatstat.model

所取代。这件事发生在4年前。请参阅 GitHub 存储库

您要安装的软件包

phenoptr

似乎尚未更新为使用当前的

spatstat

系列。特别是它应该取决于

spatstat.explore

和

spatstat.model

而不是

spatstat.core

。

我建议您联系

phenoptr

的维护者，要求他们更新他们的软件包。