无法使用 tbl_summary 获取 p 值。收到 FEXACT 错误 501

Question

我是 gtsummary 的新手。我有以下代码。我无法获得 p 值。

代码

 df %>% select(SEX,HPV_VACCINATION_STATUS) %>%
    tbl_summary(by = HPV_VACCINATION_STATUS, # split table by group
      missing = "no" # don't list missing data separately
    ) %>%
     add_p() %>%
   bold_p(t = 0.01)%>%
    bold_labels()

错误 变量“SEX”的“add_p()/add_difference()”中存在错误，省略了 p 值： stats::fisher.test(结构(c(2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 1L, 1L, : FEXACT错误501。 无法计算哈希表键，因为最大的键 大于最大可表示的 int。 算法无法继续进行。 减少工作空间，考虑使用“simulate.p.value=TRUE”或其他算法。

当我运行fisher.test(df$SEX, df$HPV_VACCINATION_STATUS)时，我遇到了同样的错误，所以它可能与gtsummary没有任何关系，但对于可能出现的问题，我们将不胜感激。

谢谢！

Answer 1

这是由

fisher.test()

引起的错误。正如错误消息所示，您可以添加

fisher.test(simulate.p.value=TRUE)

参数以使函数正常工作。

您可以使用

add_p()

参数将参数传递给

test.args

中的函数。查看帮助文件了解详细信息。