如何在 R 中对 String 对象进行子集化

Question

我有一个如下所示的

AAString ()

对象，如何对多个位置进行子集化？

df <- AAString("HAKTKIDLTBI")
df

11-letter AAString object
seq: HAKTKIDLTBI

我想取子集：

substring(df,c(1,3,4,10))

输出：

seq: HKTB

Answer 1

我不确定该方法是否适用于

AAString

对象，但你可以尝试一下

> s <- "HAKTKIDLTBI"

> idx <- c(1, 3, 4, 10)

> paste0(substring(s, idx, idx), collapse = "")
[1] "HKTB"

Answer 2

您可以使用标准索引

df <- AAString("HAKTKIDLTBI")
df[c(1,3,4,10)]
##  4-letter AAString object
##  seq: HKTB