了解R中的scale

Question

我试图理解R提供的scale的定义。我有要与之作热图的数据（mydata），并且存在非常强的正偏斜。我为scale(mydata)和log(my data)创建了一个带有树状图的热图，并且两个树状图均不同。为什么？缩放数据而不是对数转换数据意味着什么？如果我想查看显示数据列之间关系的树状图，哪一种更合适？

谢谢您的帮助！我已经阅读了定义，但它们笼罩着我。

Answer 1

log只是取向量每个元素的对数（默认为底数e）。scale，使用默认设置，将计算整个矢量的平均值和标准偏差，然后通过减去平均值并除以sd，用这些值“缩放”每个元素。 （如果使用scale(x, scale=FALSE)，它将仅减去均值，而不是除以std偏差。）

注意，这将为您提供相同的值

   set.seed(1)
   x <- runif(7)

   # Manually scaling
   (x - mean(x)) / sd(x)

   scale(x)

Answer 2

它仅提供数据的[[标准化]]。它创建的值在几种不同的名称下是已知的，其中之一是z-scores（“ Z”，因为正态分布也称为“ Z分布”）。]可以在这里找到更多信息：

http://en.wikipedia.org/wiki/Standard_score

Answer 3

这是一个较晚的补充，但我自己也在寻找有关标度函数的信息，尽管它可能也会对其他人有所帮助。