dendrogram 相关问题

树形图(或树图)是用于表示层次聚类中的关系的图。

如何在heatmap中着色分支和刻度标签。2?

我已经使用R中gplots的功能heatmap.2完成了一个热图,但是我不知道如何为每组着色分支和刻度标签(例如,如果我将树切成四个小块,如...

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如何在树状图示例中在边缘放置标签?

给出像树形图示例的树形图(源),如何将标签放在边缘?绘制边缘的JavaScript代码类似于下几行:var link = vis.selectAll(“ path.link”)...

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具有相同颜色映射的R图

以下代码生成所示的图。库(ggplot2)库(dendextend)库(cowplot)set.seed(1234)N

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recluster.cons函数和彩色树状图

我使用recluster软件包的'recluster.cons'函数创建了树状图。我想知道如何通过此功能按组对树状图的分 支着色。树

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Dendrogram图删除分支末端的树标签

使用位于此处的示例https://www.datacamp.com/community/tutorials/hierarchical-clustering-R和位于https://archive.ics.uci.edu/ml/datasets/seeds#的数据试图删除...

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Matlab中错误的树状图(与R相比)

我正在尝试基于不相似矩阵X在Matlab中制作树状图。我使用Y = squareform(X)将其转换为链接可以接受的格式。然后,我得到以下向量:Y = [0 ...

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如何绘制hclust对象至一定数量的切口?

我尝试绘制一个hclust对象。情节看起来还不错,但我想有个情节不会一直下 去,而是在5个切线处停止。我尝试了ylim,但这对情节没有任何改变。我的...

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按(索引)数字列表对pandas DataFrame行排序

我有一个具有229行的pandas DataFrame。我有一个索引编号([47、16、59,...])的列表,我想将DataFrame的行重新排序为该顺序。详细信息:我通过筛选器运行了DF(...

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绘制通过NetworkX Girvan-Newman算法发现的社区树状图

用于网络中社区检测的Girvan-Newman算法:通过逐渐从原始图中删除边来检测社区。该算法会删除“最有价值的”边缘,...

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改变树状图的分 支长度(秘籍图)

我正在尝试使用R中的库pheatmap绘制热图。我认为默认情况下,分支长度与在此步骤中合并的群集的“不相似性”成比例。我会...

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将可绘制的树状图应用于文本数据

我正在尝试使用文本数据而不是数字来创建此处所示的树状图。这个简单的示例起作用:从ff ff.create_dendrogram(X = np.array([...

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如何获得树状图中节点下所有叶子的列表?

我使用scipy.cluster.hierarchy.dendrogram,并使用以下生成的数据制作了树状图:a = np.random.multivariate_normal([10,0],[[3,1],[1,4]],大小= [100,])b = np.random ....

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将颜色条添加到聚类的热图

[我正在尝试复制这种类型的图(带有颜色条的热图,叶子)。到目前为止,这是我做的工作,以pd import numpy的形式导入panda,以NP的形式从scipy的plt导入np的matplotlib.pyplot...。

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hclust图中的ylim

我有这个简单的代码来绘制树状图,但是功能ylim似乎不起作用。因此,无论我将其设置为什么,绘制时的y范围都为[0,0.5]。我应该使用其他参数来设置...

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KMeans和创建树状图是否产生相同的标签?

我正在使用一些数据来生成一些标签,以便可以对我的数据进行排序以在有监督的学习环境中使用。我一直在生成树状图以可视化数据聚类的方式,但是......>

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手动创建树状图r

我正在尝试通过我不是通过hclust或任何其他方式获得的相似性分数来创建树状图。我有两个分支,只是想根据它们的相似程度将它们绘制出来...

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如何在R中缩放圆形树状图?

我在R中有这个圆形树状图,我想放大它。我该如何进行?在这里是:使用了以下代码:library(dendextend)library(circlize)load(file =“ hc1.rda”)#out1

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如何将scipy树状图保存为高分辨率文件?

我有一个包含600个不同标签的矩阵。因此,它确实是个大文件。当我创建一个图以对数据进行聚类时,我看不到这些标签。我应该如何创建一个高...

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SciPy的联动格式

我已经写我自己的集群处理例程,并想产生一个树状图。要做到这一点最简单的方法是使用SciPy的聚类功能。然而,这需要输入要在...

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用Matlab剪切树状图

有没有办法在Matlab中剪切树状图?我希望在100的距离有一个限制,但我无法弄清楚如何将它添加到函数中。

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