树形图(或树图)是用于表示层次聚类中的关系的图。
我有一个带标签的关系数据的2D数组(第一行和第一列)。当我创建树形图时,我的标签重叠了。如何使标签均匀分开? file = open(fileName)line = ...
我得到“ValueError:链接矩阵'Z'必须有4列。” X = data.drop(['grain_variety'],axis = 1)y = data ['grain_variety'] mergings = linkage(X,method ='complete')树形图(X,labels = ...
Python树形图必须有一个k(k \ select 2)= n)
我试图在Python中制作一个树形图,它取一些数据的中值,然后允许我计算中值之间的欧几里德距离。我的一些数据最终为负数......
我使用R的hclust(),as.dendrogram()和plot.dendrogram()函数生成了这个树形图。我使用了dendrapply()函数和一个局部函数来为叶子着色,这很好。我有 ...
我正在尝试绘制一个完整链接scipy.cluster.hierarchy.dendrogram,我发现scipy.cluster.hierarchy.linkage比sklearn.AgglomerativeClustering慢。但是,sklearn ....
在R中是否有一种方法可以直观地显示哪个属性导致分层群集中的群集?
分层聚类将基于相似度矩阵对最相似的项进行分组。但是,如何确定群集的相似之处,以及如何在视觉上展示......
FactoMineR / factoextra可视化树形图中的所有聚类
我使用FactoMineR包的HCPC函数在数据帧上执行了层次聚类。问题是,当我使用...绘制树状图时,我无法想象我询问的簇数
我正在寻找一种方法来获取树形图中基于其ClusterNode返回to_tree的聚类点的坐标。使用scipy从数据构建树形图,例如:X =数据Y = ...
我想在R中使用heatmaply后得到所有行元素的5个列表。我设置k_row = 5所以树形图显示5种不同的颜色。我只想返回一个包含5个列表的列表,每个列表包含...
我在pandas中有一个大的(106x106)相关矩阵,结构如下:+ --- + ------------------- + --------- --------- + ------------------ + ------------------ + - ---------------- + ---------------...
有没有办法在hclust树形图上计算两个节点的距离,定义为它们最低共同祖先的高度?这里可以参考一个演示示例:注释节点上的距离......
我正在尝试绘制热图以及行树形图,我操纵(修剪分支的数量),使用grid.draw对齐。这是我的数据:set.seed(10)mat
我正在尝试创建一个树形图,我的样本有5个组代码(作为样本名称/种类/等,但重复)。因此,我有两个问题,帮助将是伟大的:我怎么能显示...
我使用hclust来识别数据中的聚类,并确定这些聚类的性质。以下是一个非常简化的版本:gg
如何计算两个树状图中两个个体之间或两个聚类方法之间的共生相似性?
如何计算两棵树内的个体(不是两棵完整的树木)之间的共生距离?我想计算每个人在两个位置内的相似性/不相似性......
我想在散景中制作一个簇样式的树状图。我喜欢这个散点图的例子,但是我想让线条弯曲并显示出像这样的集群结构:http://bl.ocks.org/mbostock/4063570 ...
我想将SciPy的树形图切割成多个阈值上的多个簇。我尝试过使用fcluster但它只能在一个阈值上切割。 (这是一段代码......
我正在使用层次聚类来聚类单词向量,我希望用户能够显示显示聚类的树形图。但是,由于可能有数千个单词,我想要这个......
如何在树形图中绘制一条线,该线对应于给定标准的最佳K?像这样:让我们假设这是我的树形图,最好的K是4.数据(“mtcars”)myDend
我有一个在属级别注释的树(即每个叶子都有一个名称),我想在树枝/边缘传播叶子的颜色,只要这些孩子具有相同的属,就像在这个情节中一样:...