h5py 相关问题

h5py是一个与NumPy兼容的Python模块,用于处理分层数据格式(HDF5)文件。

HDF5到CSV转换期间出现多个错误

我有一个巨大的h5文件,需要将每个数据集提取到一个单独的csv文件中。模式类似于/ Genotypes / GroupN / SubGroupN /具有“ N”个组和“ N”个子组的调用。我已经创建了...

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由于h5py,无法通过命令提示符加载keras模型

我一直试图在.py脚本中使用h5 Keras模型使预测自动化,并使其通过Windows Task Scheduler运行。当我在anaconda jupyter笔记本上编写脚本时,脚本就消失了...

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如何为H5配置maxshape参数并追加到文件?

我正在尝试将图像数据集合并为H5文件。到目前为止,我已经设法创建了文件,但是当我追加文件时,它只会覆盖已经存在的文件。我看过其他答案(例如...

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如何创建空引用/取消设置引用?

考虑一下我有一个引用数据集f = h5py.File(“ test.h5”,“ a”)d = f.create_dataset(“ refs”,(10,),h5py.ref_dtype)d [0]#< [我可以通过...创建非null引用,...

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是否可以将每个HDF5数据集保存为.csv列?

我正在努力使用H5文件来提取数据并将其保存为多列csv。如图所示,h5文件的结构由主要组(基因型,位置和分类单元)组成。主要群体,...

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[试图打开h5py中的熊猫创建的hdf时缺少列

这是我的数据框的外观。第一列是单个int。第二列是512个整数的单个列表。 IndexID ID 1899317 [0,47715,1757,9,38994,230,12,241,12228 ... 22861131 ...

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使用h5py过滤hdf5文件中的组

我有一个问题,我找到了一个不错的解决方案,并想知道是否有更好的方法可以做到这一点。 (使用python 3.6)我想将一组实验的结果存储在不同的...

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如何从保存的模型.h5访问激活功能?

是由model.save()生成的.h5文件中存储的每个层的激活函数吗?还是已经“融入”了砝码?我正在编写一个AWS Lambda函数以生成时间序列...

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如果dtype为“

我想从hdf5文件中获取格式为{N,16,512,128}的数据集作为4D numpy数组。 N是具有{16,512,128}格式的3D数组的数量。我尝试这样做:import os import sys import h5py as h5 ...

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是否可以从HDF5数据集中删除行?

我创建了一个H5PY数据集,大约有210万个实例。问题是我已经填满了除最后一行以外的所有行。我想删除最后一行,但是不确定......>

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使用AWS boto3读取h5文件

我正在尝试使用boto3从AWS S3读取h5文件。客户端= boto3.client('s3',key ='key')结果= client.get_object(Bucket ='bucket',Key ='file')和h5py.File(result ['Body'],'r')如f:data = ...

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在键值字符串的h5py数据集中缓慢的数据检索

给出以下h5py文件根-> group1->百万个键,值对:检索任意数量的数据集(甚至1个)都花费很长时间(〜10秒),我想知道是否可以插入它们...] >

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无法创建组(名称已经存在)

从..models.encoder导入tensorflow作为tf从..models.decoder导入encoder_build进口解码器_build def compute_attention_maps(inputs,name,upsample = False):attMap = tf.reduce_sum(tf ....

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如何将多个词典保存到hdf5并合并来自不同词典的公用密钥的信息?

简而言之,我感兴趣的是有什么有效的方法可以将带有公共密钥的多个词典保存到hdf5文件中。也许我有N个具有以下结构的字典(我将在...

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预测:无法在系统权重中加载模型“ VGG16 model.h5”

加载模型“ model.load_weights(VGG16(include_top = False,weights ='imagenet'))” VGG16 = load_model('E:/TBirds/TBirdDOCS/PythonCode/DOCMODEL/vgg16_weights_tf_dim_ordering_tf_kernels_notop.h5')...

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在HDF5数据集中写入二维Numpy阵列

因此,我想使用Python(H5Py)将2D Numpy数组写入HDF5文件,但是我无法使其正常工作。这是数据集的外观。The Properties The这里的数据...

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H5Py和存储

我正在编写一些代码,需要将非常大的numpy数组保存到内存中。实际上,numpy数组是如此之大,以至于我无法一次将其全部加载到内存中。但是我可以在...

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无法在hdf5文件中写入

我正在尝试创建hdf5文件,但是输出文件为空。我写了一个python代码,该代码应该循环运行并在创建的数据集中写入字符串。保存文件后,我...

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[HDF5 in python:读取文件

我以前没用过,没问题,它突然不起作用:import scipy.io import numpy as np import h5py f = h5py.File('Dv25.mat','r')D = f [“ Dv25“]输出:追溯(最新...

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用于保存和处理大张量的高效HDF5 / PyTables布局

我正在尝试为我的用例(一个研究项目)找到最佳的数据布局。这不是我的专长,因此尽管我可以清楚地说出我想要的东西,以及我认为可行的东西,但我还是在努力引导...

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